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KRAS靶點(diǎn)難成藥?-整體解決方案來幫您

來源:上海優(yōu)寧維生物科技股份有限公司   2023年11月21日 14:57  

KRAS熱度已經(jīng)消退了?NO...據(jù)調(diào)查,現(xiàn)在除傳統(tǒng)針對KRAS靶點(diǎn)小分子藥物外,更多玩家嘗試新興療法征服這一“不可成藥”的難題,如疫苗,TCR-T療法等。KRAS可以被細(xì)胞外信號以及來自細(xì)胞器等亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的信號所激活。在正常的生理環(huán)境下,野生型KRAS主要處于不活躍的GDP結(jié)合狀態(tài)。信號促使KRAS脫離GDP,并與GTP結(jié)合,將KRAS轉(zhuǎn)化為激活狀態(tài)。激活的KRAS能夠結(jié)合并激活效應(yīng)蛋白,如RAF激酶、PI3K和RalGDS,促進(jìn)下游級聯(lián)的信號通路,如MAPK、PI3K和Ral-GEFs通路。這些信號通路通過細(xì)胞復(fù)制、生長、分化和促進(jìn)細(xì)胞周期進(jìn)程。一個激活的致癌KRAS基因?qū)е乱粋€突變的KRAS蛋白,由于GTP水解率大大降低,異常長時間保持其活性GTP結(jié)合狀態(tài)。當(dāng)KRAS蛋白被困在“ON”位置時,下游效應(yīng)通路也保持活躍,細(xì)胞增殖率保持很高。其他仍然活躍的效應(yīng)通路包括那些促進(jìn)腫瘤發(fā)展過程的通路,如有絲分裂、細(xì)胞遷移、腫瘤侵襲和血管生成。 一、高通量篩選試劑盒HTRF®技術(shù)提供均相,免洗KRAS結(jié)合檢測試劑盒,通過這些已驗(yàn)證的試劑盒,可直接用于抑制劑篩選,無需優(yōu)化,每個試劑盒配有重組蛋白、檢測試劑和緩沖液。如下圖所示,使用抗Tag1-SOS1(供體)和抗Tag2-XL665(受體)檢測Tag1-SOS1與Tag2-KRAS-G12C之間的相互作用。當(dāng)供體和受體抗體由于SOS1和KRAS-G12C結(jié)合而接近時,供體抗體的激發(fā)觸發(fā)向受體抗體的熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET),受體抗體在665nm處特異性發(fā)射。這種特異性信號與KRAS-G12C/SOS1相互作用的程度成正比。因此,化合物或抗體阻斷KRAS-G12C/SOS1的相互作用會導(dǎo)致HTRF®信號的減少。  
 使用已知抑制劑對試劑盒進(jìn)行驗(yàn)證,均獲得相應(yīng)較好的IC50并且與已報(bào)道文獻(xiàn)結(jié)果相一致。 
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63ADK000CB19PEGKRAS-WT/RAF1 binding assay kit500 tests
63ADK000CB47PEGKRAS-G12D/RAF1 binding assay kit500 tests
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 二、KRAS靶點(diǎn)相關(guān)蛋白全部KRAS相關(guān)蛋白均已原核表達(dá)系統(tǒng)(E.coli)進(jìn)行表達(dá)。通過HTRF方式驗(yàn)證其結(jié)合活性。 1、KRAS WTThe KRAS-WT activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS- WT protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.

 

2.KRAS-G12CThe KRAS-G12C activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-G12C protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal. 3.KRAS-G12D The KRAS-G12D activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-G12D protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal
4.KRAS-G12R
The KRAS-G12R activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-G12R protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.

5.KRAS-G12VThe KRAS- G12V activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS- G12V protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.
6.KRAS-G13C
The KRAS-G13C activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-G13C protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.
7.KRAS Q61H
The KRAS-Q61H activity was assayed with HTRF technology. The reaction was performed by incubating the KRAS-Q61H protein, GTP, cRAF and beads at 25℃ for 60 min, then reading Ratio 665/620nm signal.

8.SOS1 

9.RAF
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貨號品名規(guī)格
UA080001KRAS100μg
UA080002Kras[G12C]100μg
UA080003Kras[G12V]100μg
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UA080005Kras[G12R]100μg
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UA080008Kras[Q61H]100μg
UA080014cRAF50μg
UA080015cRAF50μg
UA080016SOS1100μg

*以上KRAS蛋白無GTP bound,如需GTP bound,可聯(lián)系優(yōu)寧維。上述蛋白,常規(guī)規(guī)格有:50μg,100μg和1mg,如需更大規(guī)格,可聯(lián)系優(yōu)寧維定制。 三、Anti-Tag抗體話說,不想用試劑盒的情況下,如何建立assay呢?蛋白已經(jīng)有了,還差檢測抗體...這不就來了!Anti-Tag的HTRF熒光抗體,在實(shí)現(xiàn)高通量,操作簡便等其他技術(shù)優(yōu)勢的同時,可以為assay的建立提供最大的靈活性。無關(guān)乎蛋白本身,僅針對標(biāo)簽如His,GST,F(xiàn)LAG等,選擇對應(yīng)的配對抗體即可實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)方法學(xué)開發(fā)。比如:參考上述蛋白KRAS G12C(his Tag)和SOS1(GST tag),選擇抗體配對有幾種方式可供參考:

KRAS donorSOS1 accpetor
Anti his EuAnti GST XL665
Anti GST D2
Anti His TbAnti GST XL665
Anti GST D2
KRAS accpetorSOS1 donor
Anti his XL665Anti GST Eu
Anti his D2
Anti his XL665Anti GST Tb
Anti his D2
PPI - Europium detection buffer
PPI - Terbium detection buffer 

 下圖為Anti-GST-Tb SOS1與Anti-his-XL665 KRAS G12C搭配組合展示。 
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  Anti-tag antibodies 
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61FG2XLFMAb Anti FLAG M2-XL6651000 tests
61GSTDLFMAb Anti GST-d21000 tests
61GSTKLAMAb Anti GST-Eu cryptate5000 tests
61GSTTLFMAb Anti GST-Tb cryptate1000 tests
61GSTXLFMAb Anti GST-XL6651000 tests
610HADAFMAb Anti HA-d21000 tests
610HAKLAMAb Anti HA-Eu cryptate5000 tests
610HATAFMAb Anti HA-Tb cryptate1000 tests
610HAXLFMAb Anti HA-XL6651000 tests
61MBPDAAMAb Anti MBP-d25000 tests
61MBPKAAMAb Anti MBP-Eu cryptate5000 tests
61MBPTAAMAb Anti MBP-Tb cryptate5000 tests
Buffers
貨號品名規(guī)格
61DB9RDF PPI - Europium detection buffer 200ml
61DB10RDF PPI - Terbium detection buffer 200ml

 三、下游磷酸化蛋白檢測Alpha®和HTRF®技術(shù)基于細(xì)胞水平進(jìn)行下游KRAS信號通路的研究,包括MAPK、PI3K和Ral-GEFs通路。這些細(xì)胞信號分析能夠區(qū)分化合物調(diào)節(jié)下游KRAS通路的功效。HTRF®仍然利用夾心法原理,標(biāo)記的特異性抗體識別磷酸化蛋白和總蛋白從而進(jìn)行定量檢測。全過程無需洗滌,特異性好,靈敏度高。 

下圖為p-ERK(圖左)和p-NFkB(圖右)磷酸化試劑盒靈敏度與WB對比,靈敏度高出30倍不等。


與HTRF®技術(shù)不同,Alpha®雖然也是均相檢測檢測技術(shù),但其基于化學(xué)發(fā)光原理,利用兩個微珠進(jìn)行檢測來實(shí)現(xiàn)更低的實(shí)驗(yàn)背景和超高靈敏度。一個抗體被生物素化并與鏈霉親和素包被的供體微珠結(jié)合,受體微珠則直接與另一個抗體結(jié)合。抗體與磷酸化蛋白(總蛋白)結(jié)合使供體和受體微珠靠近。供體微珠的激發(fā)使得單線態(tài)氧擴(kuò)散至受體微珠,從而發(fā)射615nm波長的光信號。Alpha®的檢測信號與樣本中存在的磷酸化蛋白(總蛋白)的數(shù)量成正比。Alpha®原理如下圖。
 

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64AKTPEGHTRF PHOSPHO-AKT (THR308) DETECTION KITS500tests
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ALSU-PAKT-B500AlphaLISA SureFire Ultra AKT 1/2/3 (pS473) Assay Kit500assays
ALSU-TAKT-B500Total AKT1/2/3 AlphaLISA SureFire Ultra Detection Kit500assays
ALSU-PMTOR-C500AlphaLISA phospho-mTOR (Ser2448) Assay Kit500assays
ALSU-TMTOR-B500AlphaLISA total mTOR Assay Kit500assays

 四、3D細(xì)胞增殖


基于ATP的發(fā)光法測定細(xì)胞增殖和細(xì)胞毒性的分析原理。用適當(dāng)緩沖液直接裂解細(xì)胞后,對細(xì)胞ATP進(jìn)行定量。在裂解細(xì)胞釋放的ATP作用下,ATP與添加的熒光素反應(yīng)產(chǎn)生光。

ATPlite 3D and ATPlite 1step 3D Assay 操作流程如下:


ATPlite 3D檢測可以允許細(xì)胞密度較高情況下進(jìn)行檢測,并且比2D檢測效果明顯。

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6016941ATPlite Luminescence Assay System1000 Assay
60169475000 Assay
601694910000 Assay


四、微孔板耗材
1.3D細(xì)胞培養(yǎng)板①板底為高度生物相容的,超低吸附力聚合物包被du有的合成聚合物MPC,源于細(xì)胞膜組分,與極性基團(tuán)的磷脂(磷脂酰膽堿)具有相同的結(jié)構(gòu),提供自然生長環(huán)境,并消除批間差異。②易形成形態(tài)大小均勻的球體細(xì)胞球體高質(zhì)量形成率,細(xì)胞形態(tài)均已一致,板材的均勻性高,可隨時聚焦進(jìn)行圖片拍攝,提供重復(fù)性更高的數(shù)據(jù)及更高效更高質(zhì)量的成像。③無需更換培養(yǎng)基實(shí)驗(yàn)的佳選擇圓底板,性價比高。
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貨號產(chǎn)品名稱規(guī)格
6055330CellCarrier Spheroid ULA MicroplatesCase of 10
6055334Case of 40


2. 其他相關(guān)培養(yǎng)板,檢測板

底透微孔板(View Plate)
實(shí)驗(yàn)應(yīng)用顏色特點(diǎn)孔數(shù)目Case of 40Case of 50Case of 60Case of 160
化學(xué)發(fā)光實(shí)驗(yàn)白色底透,TC處理96孔
6005181

384孔
6007480

黑色底透,TC處理96孔
6005182

384孔6007460


標(biāo)準(zhǔn)微孔板(OptiPlate)
實(shí)驗(yàn)應(yīng)用顏色特點(diǎn)孔數(shù)目Case of 40Case of 50Case of 60Case of 160
化學(xué)發(fā)光實(shí)驗(yàn)熒光實(shí)驗(yàn)白色非底透96孔
6005290

384孔
6007290

黑色非底透,TC處理96孔
6005270

384孔
6007270

細(xì)胞培養(yǎng)板(CulturPlate)
實(shí)驗(yàn)應(yīng)用顏色特點(diǎn)孔數(shù)目
Case of 50Case of 160Case of 200
細(xì)胞培養(yǎng)白色非底透,TC處理24孔
6005168

96孔
600568060056886005689
384孔
600768060076886007689
黑色非底透,TC處理96孔
600566060056686005669
384孔
60076606007668
             HTRF*Alpha檢測微孔板
應(yīng)用領(lǐng)域顏色特點(diǎn)孔數(shù)目Case of 25Case of 50
Case of 200
HTRF實(shí)驗(yàn)白色非底透,潛孔96孔66PL96025

6005359
Alpha實(shí)驗(yàn)384孔
6008280
6008289


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