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生物顯微鏡是一種用來觀察生物切片、生物細胞、細菌以及活體組織培養、流質沉淀等也可以觀察其他透明或者半透明物體以及粉末、細小顆粒等物體的精密光學儀器。生物顯微鏡用來供衛生單位、高等院校、研究院所用于微生物、細胞、細菌、組織培養、懸浮體、沉淀物等的觀察，可連續觀察細胞、細菌等在培養液中繁殖分裂的過程等。在細胞學、腫瘤學、遺傳工程學、工業微生物學、植物學等領域中應用廣泛。其光學技術參數包括：數值孔徑、分辨率、放大率、焦深、視場寬度、覆蓋差、工作距離等。這些參數并不都是越高越好，它們之間既相互聯系又相互制約的，實際應用中應當在保證分辨率的基礎上根據鏡檢的目的和實際情況來協調參數間的關系。
使用生物顯微鏡前，先要把顯微鏡的目鏡和物鏡安裝上去。目鏡的安裝較為簡單，主要的問題在于物鏡的安裝，由于物鏡鏡頭較貴重，萬一安裝時螺紋沒合好，易摔到地上，造成鏡頭損壞，所以為了保險起見，強調操作者在安裝物鏡時要用左手食指和中指托住物鏡，然后用右手將物鏡裝上去，這樣即使沒安裝好，也不會摔到地上。
生物顯微鏡的使用方法
先將低倍物鏡的位置固定好，然后放置標本片，轉動反光鏡，調好光線，將物鏡提高，向下調至看到標本，再用細調對準焦距進行觀察。除少數顯微鏡外，聚光鏡的位置都要放在高點。如果視野中出現外界物體的圖像，可以將聚光鏡稍微下降，圖像就可以消失。聚光鏡下的虹彩光圈應調到適當的大小，以控制射入光線的量，整理增加明暗差。
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