生物樣本庫(kù)∣核酸樣本質(zhì)控∣這些你都知道嗎?
生物樣本庫(kù)(Biobank),又被成為生物銀行。根據(jù)經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD)的定義,"生物樣本庫(kù)(Biobank)是一種集中保存各種人類(lèi)生物材料(Human biological material),用于疾病的臨床治療和生命科學(xué)研究的生物應(yīng)用系統(tǒng)"。根據(jù)GB/T 37864-2019《生物樣本庫(kù)質(zhì)量和能力通用要求》等指導(dǎo)文件,生物樣本庫(kù)必須做好核酸質(zhì)控,包括對(duì)DNA,RNA樣本的純度,濃度以及完整性做好檢測(cè)。
核酸樣本質(zhì)控方法推薦
根據(jù)GB/T40974-2021《核酸樣本質(zhì)量評(píng)價(jià)方法》,分別對(duì)DNA和RNA樣本的濃度、純度、完整性提出了推薦的質(zhì)控方法。
濃度:分光廣度法、熒光染料檢測(cè)法 熒光定量 PCR法和數(shù)字 PCR法
純度:分光光度法和 瓊脂糖凝膠電泳法
完整性:凝膠電泳法, 毛細(xì)管凝膠電泳法(安捷倫Tapestaion分析儀) 和微流控分析法(安捷倫2100生物分析儀)
核酸樣本質(zhì)控
1、安捷倫2100生物分析儀
2100生物分析儀是核酸質(zhì)控屆的常青樹(shù),是國(guó)際生物和環(huán)境樣本庫(kù)協(xié)會(huì)(ISBER)《生物樣本庫(kù)最佳實(shí)踐》,GB/T 40664-2021《用于高通量測(cè)序的核酸類(lèi)樣本質(zhì)量控制通用要求》,GB/T 40974-2021《核酸樣本質(zhì)量評(píng)價(jià)方案》等指導(dǎo)文件中推薦的生物樣本庫(kù)核酸質(zhì)控方法。
2100生物分析儀采用微流控芯片技術(shù),樣本進(jìn)入芯片后,進(jìn)行電泳分離。使用數(shù)字化評(píng)價(jià)體系,評(píng)估樣本質(zhì)量,其中RNA完整性指標(biāo)RIN值是業(yè)內(nèi)gong認(rèn)的金標(biāo)準(zhǔn)。
圖 1 微流控芯片示意圖
2、安捷倫Tapestation 分析儀
Tapestation 是安捷倫旗下推出一款du創(chuàng)的膠條式自動(dòng)化電泳分析儀,也是國(guó)內(nèi)外眾多生物樣本庫(kù)核酸質(zhì)控的選擇。這款儀器自動(dòng)化程度非常高,用預(yù)制膠條取代傳統(tǒng)繁瑣的制膠過(guò)程,膠條采用獨(dú)立泳道,有效避免污染。
圖 2 Tapestation 預(yù)制膠條
Tapestation 共有兩款型號(hào),提供靈活通量,減少單次上機(jī)成本。
4150 TapeStation
– 從兩個(gè) 8 聯(lián)管上樣
– 完整的可擴(kuò)展性:可分析 1–16 范圍內(nèi)任意數(shù)量的樣品
– 16 個(gè)樣品在 20 分鐘內(nèi)即可獲得可靠且可重現(xiàn)的結(jié)果
– 占地面積小,節(jié)省寶貴的實(shí)驗(yàn)室臺(tái)面空間
4200 TapeStation
– 可對(duì)多達(dá) 96 個(gè)樣品進(jìn)行全自動(dòng)樣品處理
– 從兩個(gè) 8 聯(lián)管或一個(gè) 96 孔板上樣
– 完整的可擴(kuò)展性:可分析 1–96 范圍內(nèi)任意數(shù)量的樣品
– 1–2 分鐘內(nèi)即可獲得一個(gè)樣品的可靠重現(xiàn)結(jié)果,90 分鐘內(nèi)可獲得 96 個(gè)樣品的結(jié)果
圖 3 Tapestation 分析儀 ,型號(hào)4150(左),型號(hào)4200(右)
Reference:
1、GB/T 37864-2019《生物樣本庫(kù)質(zhì)量和能力通用要求》
2、GB/T 40974-2021《核酸樣本質(zhì)量評(píng)價(jià)方案》
3、安捷倫5991-3143ZHCN
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