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凝膠凈化系統在對各類食品、農產品、水產品中的農殘、半揮發性有機物分析時，在有機樣品萃取物中一般會含有大分子物質，如果不去除這些物質，會導致色譜柱分離效率降低、進樣口和色譜柱的使用壽命縮短，進而影響數據分析結果。因此，在農殘、半揮發性有機物的樣品分析前，必須進行有效的凈化前處理。
凝膠凈化系統凈化分離含痕量、超痕量污染物、農藥殘留樣品等復雜基質樣品中的大分子保留目標小分子或收集目標大分子除去小分子雜質。是適于環境檢測、食品檢測及生命科學領域，提高分析靈敏度與準確性，延長色譜柱使用壽命的樣品前處理系統。系統由凈化主機及液體工作站組成，一體式設計，布局緊湊協調，可以自動化完成樣品進樣、分離凈化、目標組分收集系列操作。
凝膠凈化是樣品前處理的一類方法。是凝膠滲透色譜主要的一種技術應用。凝膠凈化系統可以自動完成樣品進樣、分離凈化、目標組分收集系列操作，工作站執行數據采集、保存和管理功能。
分離機理類似于分子篩效應，大體積分子只能滲入少量大孔，在固定相中所經歷的路徑較短，先流出。所有孔隙都不能進入的大體積分子，不被保留，在死體積處流出。
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