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凈化工作臺原理的潔凈環境是在特定的空間內，潔凈空氣(進濾空氣)按設定的方向流動而形成的。以氣流方向來分，現有的超凈工作臺可分為垂直式，由內向外式以及側向式。從操作質量和對環境的影響來考慮，以垂直式較優。由供氣濾板提供的潔凈空氣以一個特定的速度下降通過操作區，在大約操作區的中間分開，由前端空氣吸入孔和后吸氣窗吸走，在操作區下部前后部吸入的空氣混合在一起，并由鼓風機泵入后正壓區，在機器的上部，30%的氣體通過排氣濾板從頂部排出，大約70%的氣體通過供氧濾板重新進入操作區。為補充排氣口排出的空氣，同體積的空氣通過操作口從房間空氣中得到補充。這些空氣不會進入操作區，只是形成一個空氣屏障。
消毒方式：
超凈工作臺一般是用紫外線滅菌燈進行消毒的。
無菌室應定期用70%酒精或0.5%苯酚噴霧降塵和消毒，用2%新潔爾*抹拭臺面和用具（70%酒精也可）。
用****（40%甲*）加少量高錳酸*定期密閉熏蒸，配合以使無菌室經常保持高度的無菌狀態。
紫外線較長時間開啟時，可激發空氣中的氧分子締合成臭氧分子，這種氣體成分有好的殺菌作用，可以對紫外線役有直接照到的角落產生滅菌效果。
由于臭氧有礙健康，建議在進入操作之前應先關閉紫外線燈，10分鐘后即可入內。
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