聲波聚焦流式細胞儀

聲波聚焦流式細胞儀可以使用超聲波更好地將細胞聚焦于一條直線，進行激光照射。即使在較高的進樣速度下，聲波聚焦技術也可以精確地將細胞定位在液流的中心，因此細胞信號的變異系數較小，數據質量更高。作為對比，同樣在高進樣速度下，傳統的流體動力學聚焦由于鞘液壓力相對變小，樣本流的中心部分變寬，導致信號變異系數增大、數據質量下降。此外，聲波聚焦的方式允許更高的上樣量，并能夠減少樣品堵塞。聲波聚焦流式細胞儀可以利用多達4種激光和14個熒光通道對樣本進行檢測。

細胞分選儀

細胞分選儀是傳統流式細胞儀中的一種特殊類型，它允許用戶根據所需參數，選擇特定的細胞群或顆粒群，然后將這些細胞或顆粒引導到收集容器中，以供進一步研究。

細胞分選儀對樣品液流進行高頻振蕩，以產生液滴來分離細胞。然后，液滴被賦予正電荷或負電荷，并通過金屬偏轉板，在那里它們根據電荷被導向一個特定的收集容器。收集容器可以是管狀、載玻片或板狀(96孔或384孔較為常見)。

細胞分選儀有兩種類型，石英比色皿型和噴氣管型，它們的不同之處在于激光照射點的位置。石英比色皿型細胞分選儀具有固定的激光照射線路，更容易為分選做好準備。噴氣管型細胞分選儀需要每天對激光照射線路進行校準，設置起來更困難，但更適合小顆粒檢測。

成像細胞儀

成像流式細胞儀(IFC)結合了傳統的流式細胞術和熒光顯微鏡系統，這允許在單細胞和群體細胞水平上快速分析樣品的形態和多參數熒光。IFC可以像共聚焦顯微鏡或熒光顯微鏡那樣跟蹤單個細胞內的蛋白質分布，也可以像流式細胞儀那樣處理大量細胞。它們在多種應用中發揮關鍵作用，如細胞信號傳導、共定位研究、細胞間相互作用、DNA損傷和修復，以及需要對大量細胞的細胞定位與熒光表達進行協調的應用。

質譜流式細胞儀

質譜流式細胞儀結合了飛行時間質譜儀和流式細胞儀的功能。使用這種儀器時，細胞用重金屬離子標記抗體進行標記，而不是熒光標記抗體，并使用時間飛行質譜法進行檢測。但質譜流式細胞儀不具備FSC 或 SSC 光檢測功能，因此無法使用常規方法檢測細胞聚集體。此外，質譜流式細胞術不具有細胞自身熒光信號，試劑不具有與熒光標記相關的發射光譜重疊，因此不需要補償。然而，樣品在分析過程中會被破壞，因此無法進行細胞分選，并且采集速率遠低于標準流式細胞儀。

用于微珠陣列分析的細胞儀

多重微珠陣列在分析小體積樣品中的大量分析物方面已變得流行。簡單地說，這些檢測利用在特定通道中具有已知熒光量的捕獲珠和由單獨的激光檢測到的報告分子，來量化與特定珠相關的捕獲分析物的數量。

光譜分析儀

多參數流式細胞術的挑戰之一是熒光色素之間的補償(或消除光譜重疊)。一種新型的流式細胞儀，光譜分析儀就是專門針對這一問題而設計的。光譜分析儀測量多色樣品中每個熒光色素的整個熒光發射光譜，以創建光譜指紋。然后在分析過程中，每個光譜是未混合的，為每個熒光色素提供一個純信號。光譜分析正逐漸取代傳統的PMTs作為高維流式細胞術的檢測方法。