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生物顯微鏡供醫療衛生單位、高等院校、研究所用于微生物、細胞、細菌、組織培養、懸浮體、沉淀物等的觀察，可連續觀察細胞、細菌等在培養液中繁殖分裂的過程等。在細胞學、寄生蟲學、腫瘤學、免疫學、遺傳工程學、工業微生物學、植物學等領域中應用廣泛。
校準方法：
1、外觀方面
生物顯微鏡應標有名稱、型號、編號、制造廠等信息。光學系統在整個視場內成像應清晰，視場內不應有影響觀察的陰影或反射光斑等，成像的清晰區域應與視場同心。
生物顯微鏡各部分運動應靈活平穩，無卡滯和跳動現象，視場內照明均勻。雙目顯微鏡左右兩系統的光譜色應基本一致，無明顯的明暗差異。
2、生物顯微鏡物鏡放大倍數誤差
調節光源至適度位置，將帶刻度分劃尺的目鏡安裝在生物顯微鏡其中一個套筒上，將標準玻璃刻度尺置于載物臺上，調節目鏡與標準玻璃尺使分劃尺刻線與標準玻璃尺刻線平行，避免出現測量誤差。調節載物臺使玻璃尺零位與分劃尺一端對齊，然后直接讀數。
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