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一、樣品的運輸
樣品從采集結(jié)束至送達實驗室整個過程的運輸應(yīng)保證樣品本身變化最小及其中的微生物數(shù)量變化至低，盡量維持樣品采樣時的各種最初外界條件(如儲存溫度、是否需要冷藏或冷凍、避光等)。樣品應(yīng)避免破損或漏撒，產(chǎn)品標簽應(yīng)注明是否需要冰箱保存，不需要冷藏或冷凍的樣品應(yīng)放置于強度較高可以避免外界破壞的合適容器內(nèi)。
需注意：若容器內(nèi)需要加入冰袋來進行保溫時，冰袋絕不可以直接接觸樣品。
以下是各類樣品建議的運輸溫度：
(1)固體樣品：樣品周圍溫度應(yīng)≤40℃。
(2)冷凍或深度冷凍樣品：樣品周圍溫度應(yīng)低于-15℃，最好低于-18℃。
(3)其他非固體類樣品：樣品周圍溫度應(yīng)在1℃~8℃。
(4)拭子取樣型樣品：樣品周圍溫度應(yīng)在1℃~4℃，樣品運輸時間最好不要超過4h。
二、樣品接收
接收樣品時應(yīng)仔細檢查樣品的狀態(tài)，如果樣品性狀異常或樣品數(shù)量不夠，實驗室應(yīng)拒絕接受此樣品。在特殊情況下，和客戶進行溝通說明達成一致意見之后，實驗室才可以進行檢測。在這種情況下，實驗室出具的檢測報告應(yīng)記錄樣品的情況。
實驗室接收的樣品應(yīng)建立樣品檔案，對樣品檢測的整個過程都應(yīng)有相應(yīng)的原始記錄，樣品的編號必須能追溯至實驗室工作的每個環(huán)節(jié)。如果有需要的話，盛納樣品的容器的外表面應(yīng)用適宜的消毒劑進行消毒，同時仔細檢查容器外表面是否有明顯的物理損傷。
如果是易腐爛樣品，樣品的標簽上還應(yīng)注明運輸時的溫度和保鮮溫度。
接受完樣品后應(yīng)立刻檢測樣品，最好不要超過24h。或者經(jīng)過實驗室工作人員一起商議決定檢測時間。對于特別容易腐爛的樣品(如貝類)，抽樣后應(yīng)在24h內(nèi)進行檢測，其他易腐爛樣品(如魚肉、生牛奶)，檢測時間應(yīng)在抽樣后36h內(nèi)進行。
如果上述檢測時間時限因各種原因無法實現(xiàn)時，樣品應(yīng)冷凍置于-15℃以下，最好-18℃以下保存，使樣品中所要檢測的目標微生物盡量不要受到損害，并將這種因檢測時限造成的影響降到至低。
三、樣品儲存
樣品儲存的外界條件應(yīng)滿足使樣品內(nèi)現(xiàn)有的微生物的數(shù)量和種類引起變化的可能性降至至低。
建議各類樣品的儲存溫度如下：
(1)固體樣品：樣品周圍溫度為18℃~27℃。
(2)冷凍或深度冷凍樣品：樣品周圍溫度為-15℃以下，最好是-18℃以下。冷凍食品應(yīng)在45℃以下不超過15min，或2℃~5℃不超過18h解凍后進行檢測。
(3)其他非固態(tài)(包括易腐樣品)：樣品周圍溫度3℃±2℃。
(4)拭子取樣型樣品：樣品周圍溫度應(yīng)在1℃~4℃。實驗室應(yīng)盡快進行檢測，時間不要超過24h。
四、驗余樣品
驗余樣品要放置在樣品初始狀態(tài)的溫度下保存。檢驗結(jié)果報告后，被檢樣品才能處理。檢出致病菌的樣品必須要經(jīng)過無害化處理。
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