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中藥成分檢測液相色譜一般采用有機溶劑作淋洗液，因此多數采用金屬泵體，可以耐任何類型的有機溶劑，但對于酸或堿性流動相，易產生腐蝕現象。
中藥成分檢測液相色譜在生物領域的廣泛應用，為了避免金屬對一些生物活性物質的吸附作用，一些在生物方面應用的液相色譜儀器也采用PEEK材料作為泵體、流路和閥。在這一領域，離子色譜和液相色譜具有了一定的通用性。
由于樣品溶液中的各組分在兩相中具有不同的分配系數，在兩相中作相對運動時，經過反復多次的吸附-解吸的分配過程，各組分在移動速度上產生較大的差別，被分離成單個組分依次從柱內流出，通過檢測器時，樣品濃度被轉換成電信號傳送到記錄儀，
離子色譜和中藥成分檢測液相色譜均有溶劑輸送系統、進樣系統、檢測系統和信號記錄和處理系統，但由于離子色譜和液相色譜所用的流動相不同，因而檢測方式及信號處理也不同，在各部件上有一些差別。
離子色譜一般采用酸、堿及鹽的水溶液作為流動相，要求系統可以耐酸、耐堿，因此通常離子色譜裝置采用非金屬材質。例如：采用聚醚醚酮（PEEK）塑料作為泵體、流路和閥體等要求耐高壓的部分，而以聚四氟乙烯或PEEK材料作為檢測器，外接管路等。由于加工和強度方面的差異，一般情況下全塑的材料在耐壓強度和精度上比金屬材料要略低一些。
離子色譜和液相色譜的應用并不是沒有交叉，目前離子色譜已經廣泛用于有機化合物的分析，而液相色譜也可以解決大量無機離子的分析問題，兩種分離模式具有一定的互補性。一些液相色譜無法解決的分析難題，可以嘗試用離子色譜的方法來解決。
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