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環氧乙烷，是一種高效廣譜的氣體消毒劑，也是可靠和應用廣的滅菌方法。EOPO環氧乙烷丙烷反應器的滅菌是一個系統工程，一般包括預處理、消毒、解析和EO尾氣治理。
環氧乙烷滅菌過程在滅菌柜中進行，滅菌柜必須安裝在通風良好、遠離火源和靜電的地方，保持空氣流通，使用專門的排氣管道，將消毒尾氣進行無害化處理。還要定期對環氧乙烷滅菌柜的性能、滅菌指標進行檢查，以保障滅菌質量，提供合格無菌物品。
滅菌前，需要將物品徹底洗凈，否則菌體表面含有的有機物會影響環氧乙烷的穿透并消耗部分環氧乙烷，而無機鹽或者有機晶體中的微生物也難以被環氧乙烷殺滅，滅菌失敗的可能性就比較大。并且滅菌物品上不能有水滴或太多水分，以免造成環氧乙烷的稀釋和水解。
預處理環節主要是調節產品內部的溫度、濕度，這是因為微生物對EO滅活的抗力會受其含水量和溫度的影響。一般滅菌條件要求溫度約55~60℃，相對濕度在60%~80%。滅菌產品進入預處理室/柜后，由配備的加濕器、加熱平臺、熱風循環系統及空氣循環系統來控制溫度和濕度，按滅菌細則規定的條件和參數設置進行預處理。預處理結束后一定時間內（一般為60分鐘）將產品移至滅菌室。
滅菌通常在容積、規格不等的滅菌柜內進行，滅菌柜一般配有門封密閉及檢漏系統，消毒過程保持密封，滅菌過程中絕對不可以開門。
還配有真空系統、加濕系統、加熱系統、內循環風機系統和排風系統以及EO加藥和充純氮氣入口，不僅可以控制EO氣體的進入溫度；還可讓EOPO環氧乙烷丙烷反應器在真空條件下暴露于環氧乙烷中，實現充分的滅菌，并按工藝要求進行氮置換和氮清洗，滅菌完成后利用真空泵置換出EO廢氣。
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