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核酸染料是一種花青素染料，毒性低，使用安全，能有效保護實驗操作人員和環境。
1、無毒性。油性大分子特性使其無法穿透細胞膜進入細胞。Ames試驗結果也表明，這種染料的致突變性遠遠低于EB。
2、靈敏度高。適用于各種大小片段的電泳染色，對核酸遷移的影響小。
3、穩定性高：核酸染料適用于用微波或其他加熱方法制備瓊脂糖凝膠；在室溫下的酸或堿緩沖液中極為穩定，耐光性強。
4、信噪比好：樣品的熒光信號強，背景信號低，熒光強度是EB的十倍以上，亮度明顯強于EB。
5、操作簡單。與EB一樣，染料在預制凝膠和電泳過程中不會降解；電泳后的染色過程也只需30分鐘，無需脫色或洗滌，可直接用紫外凝膠透射儀觀察。
6、適用范圍廣。可以選擇電泳前染色（凝膠染色）或電泳后染色（氣泡染色）；適用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳；可用于dsDNA、ssDNA或RNA的染色。
7、核酸染料具有理想的兼容性。具有與EB相同的光譜特性，不需要更換濾光片和觀察裝置：標準EB濾光片或SYBR濾光片都適用，可以用與EB觀察相同的普通紫外凝膠透射儀觀察，在300nm紫外光附近可以獲得最佳激發。但SuperRed不能*被488nm氬離子激光或類似波長的可見光激發，所以不建議使用此類激發裝置的成像系統。
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