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倒置顯微鏡的物鏡鏡頭則處于垂直向上的位置，因此目鏡和鏡筒的縱軸與物鏡的縱軸呈45 度角。載物臺面積較大，在物鏡上方，載物臺上方有一個長焦距聚光器和照明光源。物鏡和聚光器可裝配位相顯微鏡的附件。倒置顯微鏡和放大鏡起著同樣的作用，就是把近處的微小物體成一放大的像，以供人眼觀察。只是顯微鏡比放大鏡可以具有更高的放大率而已。
操作步驟：
⒈倒置顯微鏡中常用的觀察方法就是相差。由于這種方法不要求染色，是觀察活細胞和微生物的理想方法。在此提供各種聚光器來滿足需要，這種方法提供帶有自然背景色的、高對比度的、高清晰度的圖像。
⒉開機。接連電源。打開鏡體下端的電控開關。
⒊使用：
⑴準備：將待觀察對象置于載物臺上。旋轉三孔轉換器，選擇較小的物鏡。觀察，并調節鉸鏈式雙目目鏡，舒適為宜。
⑵調節光源：推拉調節鏡體下端的亮度調節器至適宜。通過調節聚光鏡下面的光柵來調節光源的大小。
⑶調節像距：轉三孔轉換器，選擇合適倍數的物鏡;更換并選擇合適的目鏡;同時調節升降， 以消除或減小圖像周圍的光暈，提高了圖像的襯度。
⑷觀察：通過目鏡進行觀察結果;調整載物臺，選擇觀察視野。
⒋關機：取下觀察對象，推拉光源亮度調節器至最暗。關閉鏡體下端的開關，并斷開電源。旋轉三孔轉換器，使物鏡鏡片置于載物臺下側，防止灰塵的沉降。
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