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熒光顯微鏡在各領域中的應用都廣泛,在植物細胞的觀察研究中,通過染色可以更清晰地觀測到細胞的形態及結構。在實驗中發現,熒光顯微鏡還可以直接(不做任何處理)觀察植物葉的氣孔器,而且能觀察到氣孔的變化情況,為熒光顯微鏡找到了一種新用途。
倒置熒光顯微鏡 由熒光附件與倒置顯微鏡有機結合構成的，主要用于細胞等活體組織的熒光、相差觀察。 倒置顯微鏡（Inverted microscope）是為了適應生物學、醫學等領域中的組織培養、細胞離體培養、浮游生物、環境保護、食品檢驗等顯微觀察。由于這些活體被檢物體均放置在培養皿（或培養瓶）中，這樣就要求倒置顯微鏡的物鏡和聚光鏡的工作距離很長，能直接對培養皿中的被檢物體進行顯微觀察和研究。因此，物鏡、聚光鏡和光源的位置都顛倒過來，故稱為倒置顯微鏡。倒置顯微鏡多用于無色透明的活體觀察，在倒置顯微鏡的基礎上添加一套熒光附件：激光激發塊，熒光光源，熒光照明器，激發塊切換裝置，即可進行倒置熒光觀察。
倒置熒光顯微鏡是近發展起來的新式熒光顯微鏡，就其光路來分有兩種：一是透射式熒光顯微鏡，激發光源是通過聚光鏡穿過標本材料來激發熒光的。二是落射式熒光顯微鏡，這是近代發展起來的新式熒光顯微鏡，特點是激發光從物鏡向下落射到標本表面，即用同一物鏡作為照明聚光器和收集熒光的物鏡。
倒置熒光顯微鏡的用途：
熒光顯微鏡是用來看熒光標本的，它的波長短，普通顯微鏡是用普通可見光源看標本的。 原理:熒光鏡檢術是用短波長的光線照射用熒光素染色過的被檢物體，使之受激發后而產生長波長的熒光，然后觀察。
優點：檢出能力高（放大作用）• 對細胞的刺激小（可以活體染色）• 能進行多重染色用途：• 物體構造的觀察——熒光素• 熒光的有無、色調比較進行物質判別——抗體熒光等• 發熒光量的測定對物質定性、定量分析 。
倒置顯微鏡倒置顯微鏡inverted microscope組成和普通顯微鏡一樣，只不過物鏡與照明系統顛倒，前者在載物臺之下，后者在載物臺之上，用于觀察培養的活細胞，具有相差物鏡。
倒置電腦型顯微鏡倒置顯微鏡和放大鏡起著同樣的作用，就是把近處的微小物體成一放大的像，以供人眼觀察。只是顯微鏡比放大鏡可以具有更高的放大率而已。 物體位于物鏡前方，離開物鏡的距離大于物鏡的焦距，但小于兩倍物鏡焦距。所以，它經物鏡以后，必然形成一個倒立的放大的實像A'B'。 A'B'靠近F2的位置上。再經目鏡放大為虛像A''B''后供眼睛觀察。目鏡的作用與放大鏡一樣。所不同的只是眼睛通過目鏡所看到的不是物體本身，而是物體被物鏡所成的已經放大了一次的像。
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