液相色譜分析儀在聚合物分析中，吸附色譜法通常用于分離偶氮染料、抗氧化劑、表面活性劑和其他添加劑。也可用于分析石油烴的組成。
液相色譜分析儀還可用于分析氨基酸和蛋白質，也適用于分離和分析某些無機離子適用于水溶液和有機溶劑體系。當洗脫液用作水溶液時，它被稱為凝膠過濾高效液相色譜儀的色譜法，它在生物領域有許多應用。
使用前 
1、流動相需選用色譜純試劑，水為重蒸餾水；  
2、所有進儀器流動相和樣品必須經過0.45微米濾膜過濾，過濾時注意區分水系膜和有機膜的使用范圍；  
3、色譜柱使用前注意其適用范圍，如PH值、流動相類型等，建議使用保護住；  
4、確保實驗室電源接地良好，電壓穩定；  
使用中  
1、排空前確保排空閥打開；  
2、若進液管中無流動相，則排空前應先將管路抽滿流動相，避免干排；  
3、避免短時間內重復開關機；  
4、實驗數據及時定期備份；  
5、發現漏液情況，及時更換配件，防止儀器其他部件被流動相腐蝕；  
使用后  
1、清洗含鹽流動：先用10%甲醇-水溶液沖洗1小時，再用純甲醇沖洗30分鐘；下次實驗仍使用含鹽流動相，先用10%甲醇-水溶沖洗30分鐘，再使用所需流動相；  
2、若長時間不用儀器，每周開機用純甲醇運行30分鐘；  
3、儀器放置環境應該保持恒溫、干燥、無塵； 
4、請勿擅自拆卸儀器。