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隨著人類對藥物需求量的增大，傳統的落地式離心機處理效率已經遠遠不能滿足現代生產需要，連續流離心機應運而生。
其發展至今，技術日趨成熟，受到越來越廣泛的認可。在此列舉在生物技術產業中較為典型的兩類應用：高濃度酵母的分離和哺乳動物細胞的分離。
一、高濃度酵母分離：
連續流離心機在生物技術產業中的應用是對面包酵母的濃縮。到目前為止，離心機針對發酵液的流速可以達到150立方米/小時。隨著發酵產業的不斷發展及控制技術的提高，發酵罐中的酵母濃度也逐步增加。
固液體積比甚至可達25%，對于此類高濃度的物料，通常必須降低每小時的處理量才能得到比較滿意的分離效果。對于特別高濃度的酵母細胞，通常會設計逆流清洗兩次，增加回收率和下游液體的澄清度。
二、哺乳動物細胞分離：
對于哺乳動物細胞發酵產物，在分離工藝中應用連續流離心機同樣可行。很多客戶擔心哺乳動物細胞比大多數細菌和酵母細胞對剪切力更敏感，在離心機入口處原本靜止的液體遇上高速旋轉的液體，會產生不可避免的剪切力，可能會導致一些細胞破碎。
但是這種剪切力，可以通過特殊的入口設計降到小，如無空氣底部進料或碟片進料。目前已經有研究證明，空氣滯留對敏感的蛋白質是有害的，在分離細胞時，必須小心避免分離液與空氣接觸。
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