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高效液相色譜儀的系統由儲液器、泵、進樣器、色譜柱、檢測器、記錄儀等幾部分組成。儲液器中的流動相被高壓泵打入系統，樣品溶液經進樣器進入流動相，被流動相載入色譜柱(固定相) 內，由于樣品溶液中的各組分在兩相中具有不同的分配系數，在兩相中作相對運動時，經過反復多次的吸附- 解吸的分配過程，各組分在移動速度上產生較大的差別，被分離成單個組分依次從柱內流出，通過檢測器時，樣品濃度被轉換成電信號傳送到記錄儀，數據以圖譜形式打印出來。
高效液相色譜儀的保養及維護：
1、流動相的要求：
高效液相級色譜醇，二次蒸餾水，緩沖鹽一定要過濾；流動相脫氣至關重要(可采用抽濾，超聲波脫氣等方法)
2、吸濾頭：
特殊情況下可拆下濾頭抽取以判斷其中是否堵塞；亦可用注射器吸取流動相通過吸濾頭打出以判斷其是否堵塞。若有堵塞情況可用異丙醇超聲波清洗；清洗不成功則需要更換。
3、單向閥：
如遇到泵壓不穩或流動相不能抽取，則可能是單向閥出現問題，卸下用異丙醇超聲波清洗，清洗時須按其安裝的方向放置在小燒杯中，切記不可與安裝方向倒置超洗！
4、泵頭：
泵頭漏液或出現其它故障一般要申請維修(如漏液，或更換柱塞桿及其密封墊等)
5、過濾器：
當色譜峰出現異常情況時，有可能是此部件被污染，拆下用異丙醇超洗或更換過濾墊片。
6、排液閥：
此處不能*密封或漏液時一般是其中的墊片污染或磨損，可卸下后取出其墊片用異丙醇超聲波清洗或更換墊圈。
7、手動進樣器：
平時應注意用二次蒸餾水和甲醇在裝載狀態及進樣分析狀態清洗；如出現漏液現象，原因極可能為轉子密封墊磨損或污染，一般須申請維修或更換配件。
8、流通池：
在色譜峰不正常時會可能是此部件補污染。可拆卸后取出其中的墊片用異丙醇超洗(可根據說明書進行操作或申請維修)。
9、工作站：
出現死機可重起計算機；不正常運行時，首先可更換電腦測試其硬件故障；或在本機上重新插拔接口、重新安裝軟件。
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