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在線藻類分析儀采用熒光技術，通過檢測葉綠素熒光強度確定不同類的藻貢獻的葉綠素a的濃度，同時估算各類不同藻的濃度。設備能實時給出藻的總濃葉綠素a的總濃度，以及各類藻的濃度、各類藻貢獻的葉綠素濃度變化曲線。儀器把藻類分為綠藻、藍藻、硅藻和棕藻共四類分別檢測。相比傳統的培養和顯微鏡檢測方法，大大減輕工作量，加快檢測速度。設備同時檢測出各類藻的活性。樣本不需要過濾、溶解等任何預處理。
在線藻類分析儀的主要檢測參數：
1.直接檢測葉綠素熒光：分類檢測不同藻貢獻的葉綠素濃度；
同時分別估計出不同類別藻的濃度(例如藍藻濃度、藍綠藻濃度、棕藻濃度和隱藻濃度)。
2.檢測樣本中葉綠素熒光活性(Gentymenthod):
在特定條件下顯示光合作用意義下活葉綠素的百分比。
3.進行熒光法藻分類：
通過用不同顏色的發光二級管作激發光源，區分藻的類別。計算綠藻、藍綠藻、棕藻(硅藻和甲藻)及隱藻的葉綠素含量。
4.透光度：
對任何一次檢測或必要時，自動檢測透光度。檢測結果用于補償濁度對檢測結果的影響。
5.黃色物質(CDOM)：
黃色物質的熒光會影響檢測結果，為了改進葉綠素的檢測，同時檢測黃色物質，對計算的葉綠素量進行校準。
7.批量模式：在實驗室使用時，將流經模式改為單檢測模式。
在線藻類分析儀適合與在線監測，需要有適當的防護設施。檢測小站，有小房子。設備不宜暴露在陽光下，有空調設備。在監測時，設備周圍外部環境溫度應該不超過40℃。主要用在水壩監測、水道分析與評估、綜合環境監測、取水口評估、化學分析、湖泊工程、科研與教學、游泳水藻類爆發性繁殖、河流湖泊藻類生長等情況。
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