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抗核抗體譜實際是抗核抗體廣義的一組各有不同臨床意義的自身抗體。抗核抗體為細胞內全部抗原的自身抗體的總和，靶抗原分布于細胞核、細胞質、細胞骨架及細胞分裂周期，按核內各個分子的性能不同將其區分，每大類又由不同抗原特性再分為許多種類，形成抗核抗體譜。
功能作用
ANA抗體譜檢測能為臨床醫生提供更為豐富的檢驗指標，對病人的潛在疾病做出更好的提示。例如，ENA檢測的Sm抗體雖然是系統性紅斑狼瘡的特異性抗體，但是其陽性率較低，僅為5%~10%，如果使用ANA抗體譜作為檢測試劑，則有核小體，dsDNA,核糖體P蛋白三個特異性指標可以作為系統性紅斑狼瘡的檢測指標，使檢出率大大增加。可以為臨床醫生提供更為豐富的信息，從而得出更為清晰的病情診斷。
臨床應用
抗核抗體譜檢測包括的抗體及其臨床意義如下。
1. 高效價的抗U1-nRNP抗體
是混合性結締組織病（MCTD，夏普綜合征）的標志，陽性率為95%~100%，抗體效價與疾病活動性相關。抗U1-nRNP抗體可在多種風濕病中存在，并不具有特異性，在30%~40%的系統性紅斑狼瘡患者中可檢出抗U1-nRNP抗體，但幾乎總伴有抗Sm抗體。在系統性硬化中約14%陽性，原發干燥綜合征12%陽性，在肌炎患者中約15%陽性。在抗U1-nRNP抗體陽性的MCTD或SLE患者中，常與肌炎、食管蠕動功能低下、雷諾征、關節痛、指硬化和肺間質病變癥狀密切相關，而腎炎發生率較低。
2. 抗SmD1抗體
抗SmD1抗體是系統性紅斑狼瘡的特異性標志，與抗dsDNA抗體一起，是系統性紅斑狼瘡的診斷指標，但陽性率僅為5%~10%。對早期不典型SLE或經治療緩解后的SLE回顧性診斷有很大幫助。
3.抗SS-A
抗體最常見于干燥綜合征（40%~80%）、也見于系統性紅斑狼瘡 （30%~40%）和原發性膽汁性肝硬化（20%中，偶見于慢性活動性肝炎。此外，在*的新生兒紅斑狼瘡中可出現抗SS-A抗體。該抗體可經胎盤傳給胎兒引起炎癥反應和新生兒先天性心臟傳導阻滯。
4. 抗SS-A（Ro52）抗體
在自身免疫性疾病中是一個非特異性指標，與多種自身免疫性疾病都有相關性，在很多疾病處于穩定期、控制好的情況下會顯示陰性；如果陽性會提示復發或者優先于其它指標預警，起到預防提示作用。此指標合并其它指標陽性，常會提示預后不好。
5. 抗SS-B抗體
幾乎僅見于干燥綜合征（40%~80%）和系統性紅斑狼瘡（10%~20%）的女性患者中，男女比例為29:1。在干燥綜合征中抗SS-A抗體和抗SS-B抗體常同時出現。
6. 抗Scl-70抗體
見于25%~75%的進行性系統性硬化癥（彌散型）患者中，因實驗方法 和疾病活動性而異。在局限型硬化癥中不出現。
7. 抗Jo-1抗體
見于多肌炎，陽性率為25%~35%。常與合并肺間質纖維化相關。
8.抗PM-Scl抗體
在50%-70%的所謂的重疊綜合征患者中可檢出這些抗體，在這些患者中可合并出現多肌炎（PM）、皮肌炎（DM）和進行性系統性硬化癥（Scl）。抗PM-Scl抗體在進行性系統性硬化癥（彌散型）中的陽性率為3%，在多肌炎和皮肌炎中的陽性率為8%。
9. 抗著絲點抗體
與局限型進行性系統性硬化癥（CREST綜合征：鈣質沉著、Raynaud 病、食管功能障礙、指硬皮病、遠端血管擴張）有關，陽性率為70%~90%。
10. 抗PCNA抗體
對系統性紅斑狼瘡具有很高的特異性，但其陽性率僅為3%
11. 抗dsDNA抗體
對系統性紅斑狼瘡具有很高的特異性。除抗Sm抗體外，抗dsDNA 抗體也可作為該病的一個血清學指標，陽性率為40%~90%。
12. 抗核小體抗體
改良的核小體制品純度高，經電泳證實只含有核小體單體，不含H1、Scl-70、其它非組蛋白和殘留的染色質DNA成分。用該試劑進行檢測時，抗核小體抗體對SLE的特異性幾乎為100%，與健康獻血員或硬化癥、干燥綜合征和多肌炎患者血清不反應。
13. 抗一種或幾種組蛋白抗體或抗H2A-H2B復合物抗體
在藥物（普魯卡因胺、肼酞嗪以及其它藥物）誘導的紅斑狼瘡中比較常見（陽性率為95%）。另外，30%~70%的系統性紅斑狼瘡和15%~50%的類風濕性關節炎患者中也可檢出抗組蛋白抗體。
14. 抗核糖體P蛋白抗體
抗核糖體P蛋白抗體（ARPA）是系統性紅斑狼瘡的特異性標志。SLE的活動性與ARPA的效價不具有相關性，對于有中樞神經系統癥狀、腎炎或肝炎的SLE患者，ARPA的陽性率與整個SLE人群基本相同。在其它有SLE癥狀的患者中也可檢出ARPA。
15. 抗M2抗體
高效價的抗M2抗體是原發性膽汁性肝硬化的標志，丙酮酸脫氫酶復合物的酶E2和蛋白X為主要的靶抗原。另外，在其它慢性肝臟疾病（30%）和進行性系統性硬化癥（7%~25%）中也可檢出抗M2抗體，但主要為低效價。抗M2抗體陽性的進行性系統性硬化癥患者，很可能臨床重疊有原發性膽汁性肝硬化。
16. 抗Mi2抗體
在10%-15%的急性皮肌炎患者中檢測到，診斷特異性>96%。
17．抗Ku抗體
可見于1%~7%的肌炎患者。許多自身免疫疾病發現有Ku抗體，包括多發性肌炎、狼瘡及硬皮病。抗Ku抗體檢測陽性可以提示有肌炎的高度危險。
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