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在超聲提取的過程中有幾個要點是廣大超聲提取客戶需要注意的地方，如果這些地方注意不到就會影響到收率，注意事項如下：
1、浸泡時間：浸泡時間對提取效率的影響實際上是藥材濕潤程度對提取效率的影響。但若浸泡時間過長，藥材組織內的糖類、粘液質等會擴散出來，并附著于藥材表面而阻礙溶劑的進入，從而影響提出效率。針對不同的藥材，可通過實驗來確定適宜的浸泡時間。
2、提取溫度：浸泡時間對提取效率的影響實際上是藥材濕潤程度對提取效率的影響。但若浸泡時間過長，藥材組織內的糖類、粘液質等會擴散出來，并附著于藥材表面而阻礙溶劑的進入，從而影響提出效率。針對不同的藥材，可通過實驗來確定適宜的浸泡時間。
3、超聲頻率：超聲波頻率是影響有效成分提取率的主要因素之一。研究表明，對于大多數藥材而言,當其他條件一定時,目標成分的提取率隨超聲波頻率的增加而下降。但用超聲波提取技術提取益母草總生物堿時，超聲波頻率越大，提出率就越大，這表明不同藥材的目標成分都有自己適宜的提取頻率。
4、超聲處理時間：超聲提取通常比常規提取的時間要短。一般情況下，超聲處理時間在20~45min以內即可獲得較好的提取效果。相對于其他影響因素而言，超聲提取時間對提取率沒有顯著影響。
5、占空比：超聲波的占空比是超聲波的工作時間與間隙時間(脫氣時間)之比。根據操作方式的不同，超聲波提取器可分為連續式和間歇式兩種類型。連續式超聲波提取器的介質中一直有超聲波存在，而間歇式超聲波提取器在工作一段時間后，即停止一段時間進行脫氣。
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