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COSMOSIL色譜柱的技術主要包括填料技術和裝柱技術，填料的好壞對色譜柱分離性能和選擇性有決定性影響。裝柱技術沒有想象中那么簡單，不同固定相、不同粒徑、不同柱管內徑和長度，裝柱工藝都有所不同，要裝出緊密、穩定、均一的柱床，需要經驗積累。
一般情況下，正相反相柱應該都能反沖，只有兩端篩板孔徑不對稱的柱子不能反沖，不過目前這樣的柱子已經比較少見了。反沖是為了把柱頭的污染物沖洗掉，反沖后還是正著用比較好，以免柱子的兩頭都被污染。建議正向使用，反向沖洗。
使用COSMOSIL色譜柱時應當注意以下事項：
避免過高柱壓：雖然COSMOSIL色譜柱能耐受的壓力可達6000psi,但過高及過大的壓力變化均會縮短色譜柱的壽命,避免的方法是：柱壓過高時,盡可能采用較小的流速,以不超過柱允許壓力的一半為宜。當流速較大時,應采取流速梯度的辦法使流速分步到位。使用手動進樣閥時，進樣閥的切換要盡可能的快。否則超過20%的壓力沖擊會很快使柱報廢。當使用多柱聯用時，柱切換要避免在高壓下進行。
當流動相中含有緩沖鹽時，則過濾是必要的，當緩沖溶液放置一段時間(視環境溫度不同而異，夏季一般不超過48h，冬季一般不超過一周)后，在使用前還應重新過濾。
過濾流動相和樣品：流動相通常由水或緩沖溶液與有機溶劑混合而成，所有經過色譜柱的流動相均應過濾，但在實際操作上應視具體情況而有所區別:當有機溶劑用色譜純級，水用石英亞沸水或其它超純水時，在能確保水和有機溶劑的質量且沒有受到污染時，過濾并無更多實際意義。
需要加裝保護柱：保護柱的作用是過濾掉來自流動相和樣品的化學雜質的同時，也可以有效除去流動相和樣品中的不溶物。盡管現在的色譜儀在流動相吸入口、進樣閥后部以及在色譜柱的兩端都裝有1、2μm等不同孔徑的濾器,但濾器只能除去不溶性顆粒而不能除去化學污染，因此加裝保護柱是必要的，特別是在分析中藥、中成藥等復雜混合物和生物樣品時更是保護分析柱的措施。
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