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二手液質聯用儀系統由儲液器、泵、進樣器、色譜柱、檢測器、記錄儀等幾部分組成。儲液器中的流動相被高壓泵打入系統，樣品溶液經進樣器進入流動相，被流動相載入色譜柱（固定相）內。
二手液質聯用儀以液相色譜作為分離系統，質譜為檢測系統。樣品在質譜部分和流動相分離，被離子化后，經質譜的質量分析器將離子碎片按質量數分開，經檢測器得到質譜圖。液質聯用體現了色譜和質譜優勢的互補，將色譜對復雜樣品的高分離能力，與MS具有高選擇性、高靈敏度及能夠提供相對分子質量與結構信息的優點結合起來，在藥物分析、食品分析和環境分析等許多領域得到了廣泛的應用。
二手液質聯用儀錐孔和真空泵的清潔維護方法：
長期進行一級錐孔的清洗，可相應減少較為復雜的二級錐孔、六級桿等的清洗，而以及錐孔清洗的頻率一般為兩周清洗一次，若進樣數量較大，則應根據樣品數量多少及時清洗，頻率可調整至一周一次。同時，清洗時也應當將離子源溫度降到室溫、關閉阻斷閥、旋開固定錐孔的螺絲，在取下錐孔后滴數滴甲酸，將其浸潤幾分鐘后進行超聲清洗即可。需要注意的是，在錐孔超聲清洗過程中，操作人員應避免手觸碰到錐孔尖以免影響到靈敏度。
真空泵包括需油的回轉泵及無油的渦旋泵，故而真空泵需注意觀察潤滑油是否出現渾濁或缺油的情況，以及時更換潤滑油。而若想使真空泵良好運行，其油面宜在2/3處，且泵在長期運作時，操作人員每周都應擰開灰色震氣閥按鈕進行半小時震氣，使油內的雜物排出，待油霧過濾器中的油放回到泵中后再擰緊旋鈕。在更換油這一過程中，若發現油的顏色變深或液面降至一半以下，需及時更換并保存更換記錄。
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