1.進樣針堵塞，樣品沒有注入汽化室。取下進樣針，手動吸取樣品并推出，觀察能否正常吸入排出。若堵塞可選擇溶劑超聲清洗，若超聲清洗仍不能吸取，則需要更換進樣針。
2.樣口或色譜柱受污染造成樣品嚴重吸附。可以選擇溶劑沖洗汽化室，超聲清洗分流平板，分流/不分流進樣時清洗或更換襯管，更換襯管內玻璃毛，截斷一段連接進樣口端色譜柱并重新安裝老化，或選擇其它類型色譜柱等方法排除問題。
3.分流/不分流進樣時襯管內玻璃毛過多，堵塞了樣品進入色譜柱。安裝玻璃毛應取少量并安放在進樣針插入襯管針尖以下的位置。
4.進樣口漏氣或色譜柱連接二端處嚴重漏氣。檢查進樣口密封墊是否老化失效并及時更換，重新正確連接色譜柱，注意不要將螺母擰得過緊導致密封墊破碎。
5.色譜柱被堵塞。拆下色譜柱連接檢測器端，插入溶劑或水等液體中，觀察是否有連續氣泡產生。若沒有氣泡或很少量氣泡緩慢吹出，則色譜柱被堵塞，可以嘗試反接色譜柱，用大流量載氣通入色譜柱并逐段截斷或更換色譜柱。
6.進樣口汽化室溫度太低，樣品沒有被汽化。根據樣品性質升高進樣口溫度，使其能在較短時間*汽化。
7.檢測器端故障。記錄器或信號放大器連接線斷開，檢查線路連接。對于需要點火檢測器，則可能火焰熄滅，需要重新點火，熄火原因則可根據問題三排查。