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微生物質譜是蛋白質組學研究*的關鍵技術。近年來,生物質譜在鑒定通量、分辨率和靈敏度等方面均有質的飛躍,從而促進了蛋白質組研究各個領域的飛速發展。
1.核酸檢測
在核酸檢測的應用中，微生物質譜技術發揮了其*的作用。隨著現代科學對基因方面的研究愈發深入，核酸的分子生物學研究儼然成為了生命化學、分子生物學及醫學領域中非常具有活力的研究方向之一。現在通過生物質譜技術幫助核酸分子研究，不但能夠測得寡聚核苷酸的分子質量，而且能夠通過先進的技術得到它的序列信息，這也為人類的基因序列領域的研究打開了新世界的大門。
2.小分子生物標志物檢測
在小分子生物標志物檢測的應用中，微生物質譜技術也有巨大的優勢。其實，質譜技術在檢驗醫學中應用較早、較廣泛的就是用核素稀釋分析小分子生物標志物。該方法還是很多生物小分子檢測的參考方法，主要分析項目有氨基酸、脂肪酸、有機酸及其衍生物、單糖類、前列腺素、甲狀腺素、膽汁酸、膽固醇和類固醇、生物胺、脂類、碳水化合物、維生素、微量元素等，其中很多項目的方法都已經趨于完善。生物質譜作為質譜中專業的生物檢測技術參考方法，在臨床檢驗的量值溯源工作中發揮著更為重要的作用。
3.大分子生物標志物檢測
在大分子生物標志物檢測的應用中，生物質譜技術的表現也分外出色。大分子生物標志物按結構可分為蛋白質、糖蛋白和低聚核苷酸。當異常基因產生異常蛋白質后，臨床實驗室可通過測量代謝物濃度、代謝物組變化、檢測疾病相關異常功能蛋白、結構蛋白或蛋白指紋圖譜等來提供用于診斷疾病的數據，所以說，蛋白質是疾病的重要生物標志物。其中，腫瘤標志物的測定是生物質譜技術在臨床檢驗應用中較為突出和有價值的領域，微生物質譜技術有希望成為腫瘤的早期檢測方法。
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