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DNA打斷儀是基于超聲波在液體中的空化效應，換能器將電能量通過變幅桿在工具頭頂部液體中產生高強度剪切力，形成高頻的交變水壓強，使用空腔膨脹、爆炸將細胞擊碎。另外，利用超聲波在液體中傳播時產生劇烈地擾動作用，使顆粒產生很大的加速度，從而互相碰撞或與器壁碰撞而達到破碎、乳化和分離的效果。
DNA打斷儀的主要優勢有：
1.重復性好：可準確控制樣本處理過程，實驗結果重復性高；
2.處理效率高：樣本處理速度快，一次多處理多個樣本；
3.樣本*：非接觸式封閉破碎，大程度降低污染風險；
4.等溫處理：選配冷卻水循環系統，避免溫度過高對樣本造成損壞；
5.樣本損耗小；
6.片段范圍廣；
7.適用范圍廣：不同樣本只需調節超聲參數，降低了實驗成本。
DNA打斷儀主要用于細菌細胞破碎，蛋白質抽提、二代測序樣本 DNA 片段化、免疫共沉淀實驗、霉菌孢子破碎、乳化，均質，加速溶解，催化反應。
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