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有機(jī)化學(xué)起源于19世紀(jì)初，一般認(rèn)為，物理化學(xué)作為一門學(xué)科的正式形成，是從1877年德國化學(xué)家奧斯特瓦爾德和荷蘭化學(xué)家范托夫創(chuàng)刊的《物理化學(xué)雜志》開始的。而物理有機(jī)化學(xué)是依據(jù)物理化學(xué)的基本原理來詮釋、探討有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)與反應(yīng)機(jī)理，并歸納法則及發(fā)展新說的一門科學(xué)，它的發(fā)展是在建立在有機(jī)化學(xué)和物理化學(xué)發(fā)展的基礎(chǔ)上的，因此它是一門比較年輕的學(xué)科。物理有機(jī)化學(xué)的研究可以追溯到 20世紀(jì)初，但到30年代才成為一門獨立的分支學(xué)科，但除了在 60年代曾一度躋身有機(jī)化學(xué)之主流外，多年來其相關(guān)研究都不是化學(xué)研究的熱門課題。我國物理有機(jī)化學(xué)研究起步于 60年代，70年代后期以來得到發(fā)展， 主要研究成果基本上是在 80年代以來取得的。
20世紀(jì)物理有機(jī)化學(xué)的發(fā)展經(jīng)歷了一個漫長的過程。從J.Stiegliz*發(fā)表關(guān)于碳陽離子的文章到卡賓中間體的發(fā)現(xiàn)，再到 1914年W.Schlenk和E.Marcus發(fā)現(xiàn)帶陰電荷的中間體，人們開始了對物理有機(jī)化學(xué)的探索。隨著中間體的研究的深入，人們開始著手研究涉及中間體的反應(yīng)機(jī)理，并對影響結(jié)構(gòu)一活性關(guān)系的關(guān)鍵因素如立體化學(xué)、空間效應(yīng)、取代基電子效應(yīng)等有了初步的認(rèn)識。30年代開始物理有機(jī)化學(xué)有了很快的發(fā)展，并將有機(jī)反應(yīng)機(jī)理應(yīng)用于分析生物化學(xué)過程，開創(chuàng)了高聚物化學(xué)。1952年，由于Wiinson和Woodward的智慧以及Fischer的工作．使二茂鐵的結(jié)構(gòu)得以闡明。這是一個重要的轉(zhuǎn)折點，由此帶來了金屬有機(jī)化學(xué)飛速的發(fā)展，大量的過渡金屬元素有機(jī)物被合成出來并得到廣泛的應(yīng)用。由于金屬有機(jī)化學(xué)的突出發(fā)展，在此后的20多年中有多位化學(xué)家因此獲得諾貝爾獎。60年代以后，由于量子化學(xué)特別是分子軌道法用于研究有機(jī)結(jié)構(gòu)和反應(yīng)性，物理有機(jī)化學(xué)進(jìn)入了一個新的研究階段，對于有機(jī)結(jié)構(gòu)的研究直接立足于微觀結(jié)構(gòu)，而不再是由宏觀現(xiàn)象推測，研究手段由宏觀觀測向微觀觀測發(fā)展，研究方法由靜態(tài)向動態(tài)發(fā)展。
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