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植物光合儀并非僅可用于研究植物光合作用，同時包括光合、呼吸(分為植物呼吸和土壤呼吸)、蒸騰、熒光等多項測量功能，多項功能的集成使得它成為生態學研究領域上重要的*的基礎研究設備。其測量參數包括：凈光合速率(Pn)、氣孔導度(Gs)、蒸騰速率(Ts)、細胞間隙CO2濃度(Ci)、大氣CO2濃度(Ca)、光量子通量密度(PPFD)、葉溫(TL)、空氣相對濕度(RH)。如果配備葉綠素熒光葉室，可測試以下參數：大熒光(Fm)、初始熒光(F0)、可變熒光(Fv)、光化學猝滅(qP)、非化學猝滅(qN/NPQ)。此外，配備紅藍光源和注入系統還可進行自動測量多種響應曲線，如光響應曲線、CO2響應曲線等，并在相關模型支持下進一步計算光飽和點、光補償點、表觀量子效率、CO2飽和點、CO2補償點、羧化效率等多項重要生理生態指標。
在研究植物光合作用時，常需要長時間連續進行光合作用測定，因此就需要一部能滿足此項要求的植物光合儀。而隨著科技的發展，發生產的光合作用儀能夠很好的滿足光合作用測定的要求，在當前的植物生理研究中應用非常廣泛。
植物葉片是植物進行光合作用的重要器官，而葉綠素的多少直接影響光合速率的快慢，在一定的范圍內，葉綠素含量越多，光合速率越強。因此植物光合儀的測量對象一般也是針對于植物的葉片的，因此在對葉片的選擇上，應該盡量選擇有代表的葉片。由于植物葉子呈現顏色是葉子各種色素的綜合表現，主要是有綠色的葉綠素和黃色的類胡蘿卜素兩色素之間的比例決定的，因此如果測試區大部分是黃葉，那么就應該選擇黃葉，而此區大多是綠葉，則應該選綠葉。另外葉片的伸展、蜷縮、有無病蟲害以及葉片的寬窄等也會直接或間接影響光合速率，因此在選擇測試葉片的時候，也需要充分考慮這一點。
植物光合儀測定葉面積過程中，應該根據植物葉片的大小選擇所使用的葉室，只要是葉片的面積大于葉室的測量面積，那么就可以保證葉室被葉片*充滿，這種情況下就不需要改變面積參數了。
在使用植物光合儀測定植物光合速率的過程中，對于測試葉片的選擇是非常關鍵，如果選擇的不合適，就很難真實反映植物的光合速率，因此應該選擇哪些有代表性的葉片，同時植株也應該選擇能夠代表大多數葉片的植株，可以在葉片的顏色、狀態等多個角度進行選擇。
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