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色譜柱由柱管、壓帽、卡套（密封環）、篩板（濾片）、接頭、螺絲等組成，是裝填有固定相用以分離混合組分的柱管，多為金屬或玻璃制作，有直管形、盤管形、U形管等形狀。色譜柱可分為填充柱和開管柱兩大類，液相色譜通常均采用填充柱，色譜柱的分離效果取決于所選擇的固定相，以及色譜柱的制備和操作條件。
誤區1、空氣會*損壞一根HPLC色譜柱
當色譜柱不與色譜儀連接的時候，用戶需確保色譜柱被緊緊地密封。事實上，實際的應用中是，即使柱的端部進入了少量的空氣也不要緊。因為當你將色譜柱連接到色譜儀上使用時，在系統初始加壓階段，在很短的時間內空氣就會被溶劑沖刷掉。所以，不要因為色譜柱進入了空氣而認定色譜柱已被損壞。
誤區2、所有的C18（L1）色譜柱都是一樣的
由于C18色譜柱是一種廣泛應用的色譜柱，故該系統將其稱為“L1”。事實證明這個系統是不可靠的，是一個令人困惑的系統。
因為每種商品化的C18色譜柱，雖然同樣是選用硅膠作為基體，但各自都有自己特定的填料鍵合合成工藝，因此色譜性能也不相同。
比如兩種C18柱表現的色譜性能不同，后者C18固定相的鍵合比例大于前者。較低的固定相鍵合比率，表面未反應的硅醇基較多，有時混合保留機理起主要作用。
誤區3、反相色譜柱不可以使用純水相
這個誤解其實是起源于有些用戶在使用低有機溶劑含量或者純水作為反相色譜柱的流動相時，發生了俗稱相塌陷的現象，所以大家就認為反相色譜柱不可以使用純水相。
然而，事實上市售的反相色譜柱（如極性嵌入和極性封端柱）都是具有水浸潤性的，其表面特性是允許使用純水的，而不會導致塌陷或者保留時間移位。
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