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大多數重組抗體都有異構體，這些異構體主要是來自于細胞培養生產過程中的翻譯后修飾、酶解或是降解，并且在生產、純化、和存儲過程中逐步累積，有必要進行異構體分析。
異構體分析書寫基本策略
1.判類別：
據有機物的分子組成判定其可能的類別異構(一般用通式判斷)。
2.寫碳鏈：
據有機物的類別異構寫出各類異構的可能的碳鏈異構。一般采用“減鏈法”，可概括為：寫直鏈，一線串；取代基，掛中間；一邊排，不到端；多碳時，整到散。即①寫出長碳鏈，②依次寫出少一個碳原子的碳鏈，余下的碳原子作為取代基，找出中心對稱線，先把取代基掛主鏈的中心碳，依次外推，但到末端距離應比支鏈長，③多個碳作取代基時，先做一個，再做兩個、多個，依然本著由整大到散的準則。
3..移官位：
一般是先寫出不帶官能團的烴的同分異構體，然后在各余碳鏈上依次移動官能團的位置，有兩個或兩個以上的官能團時，先上一個官能團，依次上第二個官能團，依次類推。
4.氫飽和：
異構體分析按“碳四鍵”的原理，碳原子剩余的價鍵用氫原子去飽和，就可得所有同分異構體的結構簡式。
按“類別異構—碳鏈異構—官能團或取代基位置異構”的順序有序列舉的同時要充分利用“對稱性”防漏剔增。
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