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一般情況下，離子色譜儀重要包含輸液系統、進樣系統、分離系統、檢測系統等4個系統。除此之外，可依據實際檢測需要個性化配備：流動相在線脫氣設備、自動進樣系統、流動相抑制系統、柱后反應系統和全自動控制系統等等。
通常情況下，離子色譜進樣系統的基本要求是耐腐蝕、耐高壓、重復性好、操作便利。以下內容將針對三種進樣系統進行分類講解。
首先，氣動進樣系統：
氣動閥采用一定氦氣或氮氣氣壓作動力，經過兩路四通加載定量管后，進行取樣和進樣，它有效地避免了手動進樣因各人手動動作差異所帶來的偏差。
其次，手動進樣系統：
手動進樣系統采用六通閥，其工作原理與HPLC相同，但其進樣量比HPLC要大，通常情況下為50μL。樣品首先以低壓狀態充滿定量管，當閥沿順時針旋至另外一個位置時，將貯存于定量管中一定體積的樣品送入分離系統。
另外，自動進樣系統：
自動進樣器是在色譜工作站控制下，自動進行取樣、進樣、清洗等一系列程序動作，色譜儀使用者只須將樣品按次序裝入貯樣機中。圓盤式自動進樣的工作步驟大體可以分為以下幾個步驟：
1、電機帶動貯樣盤旋轉，待檢測樣品置于取樣針正下方。
2、電機正轉，絲桿帶動滑塊向下移，把取樣針插入樣品塑料蓋，滑塊繼續下移，將瓶蓋推入瓶內，在瓶蓋擠壓下樣品經管道流入進樣閥定量管，實現取樣動作。
3、進樣閥切換，實現進樣。
4、電機反轉，絲桿帶動滑塊上移，取樣針恢復原位。
自動進樣能夠到達很寬的樣品進樣量范圍的目的。
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