農藥能防治病、蟲、草害，如果使用得當，可保證作物的增產，但它是一類危害性很大的土壤污染物，施用不當，會引起土壤污染。

噴施于作物體上的農藥（粉劑、水劑、乳液等），除部分被植物吸收或逸入大氣外，約有一半散落于農田，這一部分農藥與直接施用于田間的農藥（如拌種消毒劑、地下害蟲熏蒸劑和殺蟲劑等）構成農田土壤中農藥的基本來源。

農藥是土壤中主要的有機污染物，直接進入土壤的農藥大部分可被土壤吸附。質地黏重的土壤吸附力強，砂土吸附力弱。水分增加時，土壤對農藥的吸附力減弱。隨著土壤水分的蒸發，農藥可從土壤中逸出，進入大氣或流入水體中污染大氣和水體。土壤有機質含量高，微生物種類多時，會加速土壤中農藥的降解，減少農藥的殘留量。但會間接的被農作物吸收，引起瓜果蔬菜的農藥殘留超標，所以土壤中農藥殘留也是需要進行檢控的。

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