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浮游菌采樣器是根據顆粒撞擊原理和等速采樣理論設計，采樣直接，采樣口風速與潔凈室內風速基本一致，能更準確地反映潔凈室內的微生物濃度。要想設備能更長、更高效的工作，應做好設備的日常維護工作：
1、不要讓設備長期接觸腐蝕性物質：雖然日常采樣的過程中，難免會出現一些有腐蝕性的氣體和液體，但是接觸采樣器的時間不能太長。而且使用設備之后，還是需要做好清潔工作，以免會影響到后續的測試。而且長期接觸到腐蝕性的氣體等，也會導致采樣器出現故障，所以要注意好應用情況。
2、正規操作人員應用：因為每種浮游菌采樣器的應用方式和采樣也不同，所以設定好設備之后，采樣開始工作人員就需要離開現場，以免有一些細菌等帶入到其中，這樣可能也會影響到采樣檢測的結果。
3、做好矯正工作：因為采樣器還是需要進行后續的矯正，不管應用頻率如何，還是需要每年至少做好一次的矯正工作，減少采樣時出現誤差的可能。
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