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凝膠成像系統對于一些工作來說是有很大的幫助的，所以使得越來越多的人開始接觸這樣一種產品，但是在凝膠成像系統的使用過程當中，可能會出現很多的問題。對于操作者來說，是需要正視這些問題的，也只有這樣才能夠保證在使用的過程當中不會因為一些困擾而影響工作的進程，這是非常值得注意的一點的。
一般情況下來說，是不是像素越高產品就越好呢？像素針對的是成像設備來看的，所以凝膠成像系統和一些數碼相機的像素是沒有可比性的，應該主要是本身的質量比單單純的像素高低更加重要，也只有這樣才能夠知道一些指標的大小和尺寸。如果是尺寸越大的話，其本身的價值就更高。
還有就是紫外線反射燈源使用并不廣泛，所以在使用凝膠成像分析系統的過程當中，提供一些非透明材質的載體，這樣才能夠保證透射的光源是可以*的，同時將紫外反射光源作為選配件不列入標配當中。凝膠成像系統是可以保證直接進行一些系統的觀察中間的觀察窗的。另外就是可以打開左右兩側，專門為割膠所涉及的小門進行切膠的操作。因為**重要的是需要調節參數和焦距聚焦和光圈的問題的。通過焦距調節清晰度，聚焦調節圖像的大小，可以知道一些教具是不是處在清晰的狀態下，這一點是尤其需要注意的。
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