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功率超聲波清洗機的原理是利用超聲波發生器的橫頻信號，由換能器轉換成橫頻機械振動，傳遞給介質清洗液。強超聲波在清洗液中以密集相間的形式輻射到被清洗物體，出現“空化”現象，即在清洗液中形成“氣泡”，當聲壓或者聲強受到壓力到達一定程度時候，氣泡就會迅速膨脹，然后又突然閉合，產生上千帕的壓力及局調溫，使物體表面、孔和縫隙中的污垢分散、破碎、剝落，使物體得到凈化和清潔。
超聲波細胞破碎儀工作原理是基于超聲波在液體中的空化效應。換能器將通過變幅桿的電能在刀頭頂部的液體中產生高強度的剪切力，形成高頻交變水壓，使腔體膨脹爆炸，粉碎細胞。另一方面，由于超聲波在液體中的劇烈擾動，粒子產生大的加速度，使它們相互碰撞或與裝置壁碰撞而破碎。一般廣泛應用于生物化學、醫藥、食品檢測、環境監測等領域，打破動植物組織、病毒、細菌等細胞的結構，以及在乳化、分離、均質等化學反應過程中。
功率超聲波清洗機與超聲波細胞破碎儀的區別：
要說這兩款儀器有何不同，雖然他們之間原理是相通的，但主要區別在于超聲波細胞破碎儀是將所有能量集中在探頭上，而超聲波清洗機的能量均勻分布在清洗槽底部。因此，超聲波清洗器更傾向于脫氣和清洗，而超聲波破碎儀則傾向于細胞破碎、乳化及均質。
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