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離子色譜儀廣泛應用于環境、電力、衛生、能源、農業、食品飲料、醫藥、檢驗、化學、工業、科研等領域。
進樣分析作為離子色譜儀實驗的關鍵一環，操作時更要謹慎：
1、用去離子水將注射器、針頭清洗干凈。
2、用盛去離子水的洗瓶將進樣口清洗2-3次。
3、將閥打到“進樣”位置,用注射器各吸取1-2ml去離子水、樣品依次注入將定量環清洗3次(注意：注射器中不能有氣泡)。再吸取1-2ml(一般取1.0ml)樣品注入，迅速將閥打至“分析”位置(注意動作要快，在1s內完成)，同時按動“啟動”按鈕采集信號或儀器開始自動采集信號，并分析樣品。
4、樣品出峰完畢，點擊“手動停止”按鈕或F10或到工作站中?采集時間?的設定時間停止譜圖信號采集，于彈出的“另存為對話框”中更改譜圖文件名，將譜圖保存。
5、離子色譜儀實驗完畢后，將泵關閉，將色譜柱卸下，兩端用柱接頭擰緊將其密封，放于儀器內保存。(如果是陰離子檢測時要再將電流旋鈕關閉)
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