曝氣生物濾池反應器為周期運行，從開始過濾到反沖洗完畢為一個的周期。具體過程如下

    經預處理的污水從濾池底部進入濾料層，濾料層下部設供氧的曝氣系統進行曝氣，氣水為同向流。在濾池中，機物被微生物氧化分解，NH3-N被氧化成NO3-N；另外，由于在堆積的濾料層內和微生物膜的內部存在厭氧/缺氧環境，在硝化的同時實現部分反硝化，從濾池上部的出水可直接排出系統。

    隨著過濾的進行，由于濾料表面新產生的生物量越來越多，截留的SS不斷增加，在開始階段濾池水頭損失增加緩慢，當固體物質積累達到一定程度，使水頭損失達到限水頭損失或導致SS發生穿透，此時就必須對濾池進行反沖洗，以除去濾床內過量的微生物膜及SS，恢復其處理能力。

    曝氣生物濾池的反沖洗采用氣水聯合反沖，反沖洗水為經處理后的達水，反沖洗空氣來自于濾板下部的反沖洗氣管。反沖洗時關閉進水和工藝空氣，先單氣沖，然后氣水聯合沖洗，后進行水漂洗。反沖洗時濾料層輕微膨脹，在氣水對濾料的流體沖刷和濾料間相互摩擦下，老化的生物膜與被截留的SS與濾料分離，沖洗下來的生物膜及SS隨反沖洗排水排出濾池，反沖洗排水回流預處理系統。