離子色譜技術應用于水質監測中的化學性質分析，主要用來測量其中的無機陰陽離子的分析，以及有機酸堿的分析。

前者來說，利用離子色譜分析技術監測水樣中的無機陰陽離子，提升離子分析的效率和效果，能夠將之前的25min左右才能分析出一種離子的低效監測能力，一下子可以顯著提升至7min內能夠分析出36種離子的高效監測效果。因此，離子色譜技術的應用推動了化學分析達到了發展。
就后者而言，將離子色譜技術應用于有機酸堿分析。在含有取代基、空基的酒酸、乳酸、檸檬酸等各種控酸、多基酸應用領域，這些多基酸或控酸難以使用氣相色譜技術進行深度分析，而離子色譜技術的應用便有效地解決了這一難題，可以有效分析出被監測水質各液相中的有機酸、有機堿的組分情況。
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