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在線色譜儀利用色譜柱先將混合物分離，然后利用檢測器依次檢測已分離出來的組分。色譜柱的直徑為數毫米，其中填充有固體吸附劑或液體溶劑，所填充的吸附劑或溶劑稱為固定相。與固定相相對應的還有一個流動相。流動相是一種與樣品和固定相都不發生反應的氣體，一般為氮或氫氣。待分析的樣品在色譜柱頂端注入流動相，流動相帶著樣品進入色譜柱，故流動相又稱為載氣。載氣在分析過程中是連續地以一定流速流過色譜柱的，而樣品則只是一次一次地注入，每注入一次得到一次分析結果。樣品在色譜柱中得以分離是基于熱力學性質的差異。
在線色譜儀主要應用場景：
一、室內環境檢測行
建材產品質量檢測中心，室內空氣檢測公司，建筑工程質量檢驗測試站，環境檢測站等需要用其分析空氣質量、材料質量等。
二、食品行業
酒業，酒廠，白酒廠，啤酒廠，釀酒公司，食品廠，蜂蜜廠等需要卷煙廠用氣相色譜儀分析不同食品中組成的含量。
三、科研及事業單位
產品質量監督檢驗所，研究所，設計院，技術學院，大學化學系，農業質量監測中心，白蟻防治研究所，燃氣公司，有機化學所，自來水廠，包裝廠，涂料廠，農藥廠，飲料廠等同樣需要用它分析、檢測、研究。
四、化工行業
制藥廠、農化公司，精細化工，生物化工，石油化工，液化器廠、燃氣廠，氣體廠，煤炭工業，日用化工，糧油公司等用其分析檢測。
五、醫藥行業
司法鑒定中心，制藥廠，疾病控制中心等也需要用上在線色譜儀；
環境保護：大氣水源等污染地的痕量毒物分析、監測和研究；
生物化學：臨床應用，病理和毒理研究；
食品發酵：徽生物飲料中微量組分的分析研究；
中西藥物：原料中間體及成品分析。
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