生物制劑調配好之后應裝在一定形狀的容器中，再放入凍干箱內預凍。生物制品一般用瓶裝。瓶子有小玻璃瓶和血漿瓶等 。小瓶塞材料一般為丁基橡膠制造，頂部為塞蓋，中間為直徑與瓶口內徑配合緊密的圓柱部，下部為帶槽的支撐部。在產品分裝后由半加塞機將塞子放在瓶口上。怎樣分裝溶液呢？分裝在分裝機上進行。溶液在托盤、小瓶中的高度一般為10～15mm，深不得超過18mm。這樣凍干周期可控制在18～24h內。為減小溶液凍結后的深度，對裝量大的產品可采用水平或立式旋轉凍結成殼狀，以增大其外表面積，可大大縮短干燥時間。升華干燥結束可以從這幾方面判斷：1、干燥層和凍結層的交界面達到瓶底并消失。2、產品溫度上升或平行于導熱油溫度。  3、干燥箱內壓力下降到冷凝器的壓力，兩者接近且壓力維持不變。真空冷凍干燥機使用時的注意事項：1、用真空冷凍干燥機制備樣品應盡可能擴大其表面積，避免含有酸堿物質和揮發性有機溶劑; 2、必須*凍結成冰，如有殘留液體會造成氣化噴射; 3、真空冷凍干燥適合做高附加值物質;