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島津氣質聯用儀被廣泛應用于復雜組分的分離與鑒定，其具有GC的高分辨率和質譜的高靈敏度，是生物樣品中藥物與代謝物定性定量的有效工具。
軟件功能：
工作站軟件可同時控制氣相色譜儀、自動進樣器和質譜儀，通過高速網卡實現數據采集與傳輸；
支持全掃描和選擇離子掃描模式；
可實現FULLSCAN、SIM掃描；
支持手動調諧和自動調諧；
實時顯示總離子流譜和質譜圖譜；
可快速提取離子和全掃描圖譜；
數據處理軟件可依據樣品的質譜圖在NIST2011譜庫中進行目標化合物自動搜尋,并顯示搜尋結果。搜尋結果顯示每個化合物的實測保留時間、分子結構式與標準圖譜，確認離子之間的標準豐度比與實測豐度比等以供使用者準確定性、定量分析。
島津氣質聯用儀的離子源和預桿的清洗：
1.清洗前先準備好相關的工具及試劑，然后打開機箱，小心地拔開與離子源連接的電纜，擰松螺絲，取下離子源。取預桿之前先取下主四極桿，豎放在無塵紙上，再取下預桿待洗。注意整個操作過程一要小心謹慎，二要避免灰塵進入腔體。
2.將離子源各組件分離，在離子源的所有組件中，燈絲、線路板和黑色陶瓷圈是不能清洗的。而離子盒及其支架、三個透鏡、不銹鋼加熱塊以及預桿需要用氧化鋁擦洗，將600目的氧化鋁粉用甘油或去離子水調成糊狀，用棉簽蘸著擦洗，重點擦洗上述組件的內表面，即離子的通道。
3.氧化鋁擦洗完畢后，用水沖凈，然后分別用去離子水、甲醇、丙酮浸泡，超聲清洗，待干后組合好離子源，先安裝好預桿、四極桿，再小心裝回離子源，蓋好機箱，清洗完畢。
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