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單細胞分選摒棄一貫以來通過微珠實現液滴延遲的做法，這樣可減少因噴嘴堵塞而重新計算液滴延遲時間時需要取出無菌樣品的情況，從而確保分選過程中無菌狀態不會中斷。此外還能監測及保持液滴斷點的穩定以實現無間斷無菌分選，確保分選的完整性。
雙前向角散射光檢測技術可實現同時在三個數量級上測量散射光信號的特性，適當的波長選擇則可將檢測范圍擴大至405–640nm，從而可對較小和較大的顆粒進行檢測。借助該儀器，研究人員可對品類繁多的生物樣本進行研究工作，從微粒體到巨噬細胞到異種移植體，全都可以進行分析和分選。
該儀器還可用于一些非生物學應用，比如瓊脂糖凝膠液滴、金納米粒子或環境顆粒；或者單細胞研究，比如循環腫瘤細胞、新藥研發、稀有分析、干細胞和神經細胞以及微生物生態和生理學等。
傳統的熒光活化細胞分選方法采用流式細胞術用來分選細胞，是分子基礎分選中普遍使用的方法，這種方法只能檢測具有熒光活性的細胞，不但細胞存活率低、純度低，而且極易破壞細胞組織。單細胞分選儀器是一款與倒置顯微鏡配合使用的，用于細胞篩選、提取、沉積的理想設備，該系統可以靈活的與各種類倒置顯微鏡配合，安裝操作也簡單。如果用戶已經擁有自己的顯微鏡系統，只需購買標準配件就可以將現有的系統升級為一套多功能、高精準的細胞分選平臺。
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