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離子色譜儀主要用于環境樣品的分析，包括地面水、飲用水、雨水、生活污水和工業廢水、酸沉降物和大氣顆粒物等樣品中的陰、陽離子，與微電子工業有關的水和試劑中痕量雜質的分析。另外在食品、衛生、石油化工、水及地質等領域也有廣泛的應用。
離子色譜儀操作過程中需要有專人保管、專人使用，注意儀器間的潔凈，保持無塵，儀器不能正對著空調出風口，出現故障時應及時采取正確應對措施、上報并作好記錄。
離子色譜儀儀器日常維護：
1.儀器日常應保持無塵。
2.必須保證電源的良好接地。
3.配制淋洗液所有試劑必須優級純度試劑，配好的淋洗液用帶0.45um水系濾膜過濾后，再超聲20分鐘。
4.常規樣品溶液進樣前，需用0.45um水系濾膜過濾，以免堵塞色譜柱和抑制器。含有機物/金屬離子濃度較高的復雜樣品，進樣前需用專門的前處理柱去除樣品中的有機物或金屬離子。
5.管路出現漏液的情況下，應首先關閉抑制器電流；禁止在沒有流速的情況下開抑制器電流，否則抑制器易被燒壞。
6.若該儀器使用頻率不高，建議不用前用超純水將流路中的鹽清洗干凈，以免堵塞電導池或管路。辦法是定期(每周)開機運行30分鐘后關機。
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