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柱溫箱是色譜分析中目標組份分離度是否很好的關鍵因素，是氣相色譜分離度的重要參數之一，很好的柱溫程序，可以得到很好的峰形、短的分析時間，即很高的柱效；
柱溫箱的溫度設置方法類型分為兩種：
1.一種是柱溫箱的溫度是恒定的；
2.一種是程序升溫。溫度是固定不變的色譜柱溫過程稱為恒溫色譜，即色譜柱的溫度保持不變，該方法主要應用于各組分之間的沸點差異不大保留性質差不多的組分。
程序升溫指的是色譜柱的溫度是隨著分析時間而變化，通常柱溫的起始溫度比較低，其目的是讓低沸點的組分能夠有好的分離；隨后通過溫升程序，讓不同沸點的組分有順序的分離開來，通常在較高溫度下保留一段時間，這樣可以讓峰整體往前移動，縮短分析時間；程序升溫主要應用于分析組分中組分之間的沸點分布比較廣，在恒溫條件下，因低沸點組分很容易重疊，高沸點組分峰型易拖尾，很難進行定性、定分析的情況下，通過溫度階升程序讓各組分有順序的分離開來。
終設置的溫度不能超過色譜柱zui高耐受溫度，通常對于組分比較干凈的樣品。我們只需設置終的溫度比后一個出峰時的溫度高20℃即可，但是對于分析復雜的樣品，通常所說的樣品“很臟”的時候，我們需要設置較高的溫度，以便把殘留在色譜柱中的高沸點污染物趕出柱子，避免影響下一次的分析。
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