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島津氣相色譜儀由以下五大系統組成：氣路系統、進樣系統、分離系統、溫控系統、檢測記錄系統。
島津氣相色譜儀又稱GC色譜儀，它是以氣體為流動相（載氣）。當某一種被分析的多組份混合樣品注入汽化室且瞬間汽化后，樣品由載氣攜帶，經過裝有固定相的色譜柱時，由于組份分子與色譜柱內部固定相分子間要發生吸附、脫附溶解等過程，在載氣的沖洗下，各組份在兩相間作反復多次分配（即保留時間和作用力不同）并在柱中得到分離，隨后順序通過柱后檢測器依次被檢測出來，并轉換為電信號送至色譜數據處理系統繪出色譜圖給出定量、定性分析結果。
氣相色譜儀儀器室環境要求：
1、環境：氣相色譜儀儀器室及其周圍沒有火源強磁場和電場?存在易燃，易爆和腐蝕性物質，以避免干擾分析或事故。
2、溫度和濕度：室內溫度在10到35°C的范圍內，相對濕度低于80％，以確保氣相色譜儀組件能夠正常工作。有一臺空調器進行干燥和排氣。
3、防塵防塵：應盡可能減少室內空氣中的灰塵含量，以減少落入氣相色譜儀的灰塵，以免影響氣相色譜儀的性能。窗戶應配有紗布，注意保持儀器和房間清潔。
4、臺面：氣相色譜儀工作臺應能承受整套儀器的重量。高度一般為70厘米左右，寬度為70~80厘米，距離墻壁約30厘米。臺面上的橡膠板應該是合適的。
5、防火和防爆：氣相色譜儀色譜室必須嚴格禁止*。防爆燈應用于照明。必須提供滅火器，以實施防火和防爆等安全措施，以避免發生事故。
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