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拍擊式均質器主要用于食品、生命科學領域和臨床/醫藥領域，如：食品微生物分析、組織培養、細胞生物學、生物化學、活體組織處理和痰(結核病鑒定等)處理。例如：拍擊式均質器可以用來制備組織樣品，單獨的細胞懸浮液可在幾秒鐘內準備好而不需傳統的幾分鐘，大大節約了時間，提高了效率。拍擊式均質器*的為“組織培養”制備大量的具有活性的細胞（即使用拍擊式均質器處理樣品會減少處理過程中細胞的死亡。）食品工業中的藥物殘留問題隨著新農業技術的發展越來越重要。拍擊式均質器為其分析提供快速清潔的萃取溶液的生產。在臨床實驗室痰樣品的勻化， 使用拍擊式均質器是比用酶消化更好的方法。無酶分析可以使在一個樣品中同時進行細菌學，免疫學和生物化學的實驗，而且結果非常快——與傳統方法比相當于1到2分鐘與半個多小時的比較。
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