實施效果
來源:計算模擬平臺
通過 Discovery Studio 軟件設計指導了變構肽配體(Altered peptide ligands,APLs)用于治療I型糖尿病。
方案詳情
I型糖尿病在人類和非肥胖糖尿病小鼠中均是一種自身免疫系統缺陷的疾病,有研究表明其主要由于 CD8+ T 細胞介導的β細胞損傷,使之不能正常分泌胰島素。變構肽配體(Altered peptide ligands,APLs)可以有效抑制抗原-特異性T細胞失效,凋亡或轉移。因此開發有效的 APLs 用于I型糖尿病的治療很有必要。本文通過分子模擬技術對變構肽配體進行了設計和優化。
文章作者基于已知的變構肽配體與受體的復合物結構,首先通過 Discovery Studio突變了復合物結構中的關鍵氨基酸殘基,確定了變構肽的關鍵改造位置,并設計了8個變構肽配體。然后結合DS_Loop refinement 和分子動力學程序 Standard Dynamics Cascade 對8個變構肽配體的復合物進行了結構模擬和優化,并基于MM-PBSA 方法預測了它們與受體之間的結合能,根據預測結果(表1)選擇其中四個肽進行了合成和生物活性測試,其中變構肽 H6F 活性較好。針對 H6F 進行了后續的試驗研究,試驗結果表明變構肽配體 H6F 有希望成為一個治療I類糖尿病的藥物。
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