物料從轉鼓底部的進料口進入高速旋轉的轉鼓，當物料流過碟片之間的間隙時，高速臺式實驗室離心機在離心力作用下，較重的固相物料向上層碟片的下表面運動，沉降到上層碟片的下表面上形成沉渣層，沉渣沿碟片表面滑動而脫離碟片，積聚在轉鼓內直徑大的部位，經排渣口排出機外。較輕的液相物料沿下層碟片的上表面向轉鼓的軸線流動，經轉鼓上部的排液口排出機外。檢查其他部位有無松動及不正常情況，接通電源依順時針方向開車啟動(通常從靜止狀態到正常運轉約需40-60秒左右)。通常每臺設備到廠后均須空車運轉3小時左右，無異常情況即可工作，物料盡可能要放置均勻。必須專人操作，容量不得超過額定量。
　　高速臺式實驗室離心機開動后，若有異常情況必須停車檢查，必要時需予以拆洗修理，工作時是高速運轉，因此切不可用身體觸及其轉鼓，以防意外。軸承內缺油或軸承內有污垢較多而引起摩擦阻力增大，電機達不到額定轉速，應及時清洗或更換軸承。檢查指示燈保險絲及室內配電板保險絲是否熔斷，同時檢查電源線是否接觸良好，如保險絲斷則應更換保險絲并保持電路暢通。
　　機體應始終處于水平位置，外接電源系統的電壓要匹配，并要求有良好的接地線，開機前應檢查轉頭安裝是否牢固，機腔有無異物掉入，樣品應預先平衡，使用離心筒離心時離心筒與樣品應同時平衡，揮發性或腐蝕性液體離心時，應使用帶蓋的離心管，并確保液體不外漏，以免腐蝕機腔或造成事故。