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1、了解自己的用水品質，即我們常說的水質的電阻值或電導率是多少。目前實驗室用水有的國家標準GB6682-2008，其對實驗室用水中的一、二級用水對電導（電阻）、可氧化物、吸光度、可溶性硅及蒸發殘渣作了要求，其參照標準為ISO3696:1987，是目前通用的標準。
2、客戶可以根據使用的儀器種類來選擇國產實驗室超純水設備。液相用水的電阻大于18兆歐；并且要去除有機物；原子吸收、原子熒光及環境監測儀器用水大于18兆歐就行；PCR等生命科學儀器用水除了電阻大于18兆歐以外，還需除菌，除有機物，除熱源。
3、原水水質也是必須考慮的因素之一。比如泥沙多，硬度高，地下水等情況，國產超純水設備的工藝是根據原水水質的好壞來確定的，泥沙多，要添加預處理裝置，硬度高，要添加軟化裝置，含鹽量高，要采用二級反滲透工藝等。如果選用以純水為水源的超純水機，則只需要提供水質需求和用水量就可以了。
4、實驗室純水系統設計還應考慮的因素是：純水系統的供貨商是否有能力進行整體純水系統的設計、工程指導、、售后服務以及系統的驗證校驗支持。
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