1.冷凍干燥機冷阱室
冷凍干燥機每次工作前須注意清除冷阱室內的水分。必要時擦干冷阱。建議每次進行冷凍干燥工作前先開排水閥，然后再關上它。
2.對真空橡膠密封閥要加特別注意。
冷凍干燥機每隔數月應檢查一次機器底部的液化器是否有塵土及污物，冷必要時需要清潔。檢查熱交換器時要側翻機箱使之躺在軟墊上。可酌情使用高壓空氣吹凈熱交換器。液化器過臟會提高功耗甚至損壞機器。
3.冷凍干燥機本機不可倒置
故障提示
斷電
冷凍干燥機過程中斷電可能會造成材料的損壞，是否能進行搶救取決于在哪一工作階段停電。以主干燥和后干燥過程區別，干燥過程中，被干燥物品殘留水分已經低于5％，一般長時間斷電不會受到損壞。主干燥過程中斷電則建議通氣，取出物品置于冰箱中。重新干燥前要把凝結的水放出。
4真空度不夠
冷凍干燥機出現這種情況首先要檢查放水閥橡膠密封閥。我們建議拆下機器右側板然后擰下放水閥門，用橡膠塞堵住管口然后抽真空。如果能達到工作需要真空度，問題出在放水閥密封上。一般由附著干燥殘余物及抹布絲頭造成。我們建議開機抽真空用氣流吹去排水閥上的附著物。如果以上不能解決問題須清潔或更換閥門。檢查真空泵充油，必要換掉臟油，檢查壓力。
檢查干燥空磨口是否在整個密封面上均勻涂布了真空油。冷凍干燥機采用帶8個真空橡膠密封閥的干燥室時應摘下真空橡膠密封閥，用橡膠塞堵上接口，抽真空進行檢查并依次換裝真空橡膠密封閥進行檢查。檢查真空度傳感器，看其是否有水蒸發殘留物堵塞。真空傳感器如有損壞應進行更換。
如方便可用標準真空度計進行比較。為找出密封不嚴的地方，可以把真空度計直接通在真空泵抽氣口。如果能達到0.011毫巴則可知真空泵及測量系統*。有時因為凝冰溫度不夠低達不到真空度。如果以上步驟確定不了密封不嚴處，請檢查各小法蘭連接。一般情況下這些密封環不要求真空油。
5.真空泵不工作：
冷凍干燥機真空泵驅動馬達有保護開關。一般注意事項：進行真空度檢查應在冷阱室深凍時進行。真空度計校準連續工作時，直少每年應校正一次真度計，因為其工作點可發生漂移，可借助于“ATM”(大氣壓)“800mbar”檔。應當校準兩點的值：“ATM”＝大氣壓“HV”＝高度真空一般沒有高度真空時比較穩定，只進行大氣壓力校準即可。校正“ATM”：把TPR250傳感器插頭插在ALPHA1-2機后的插座中，開機進選擇真空度指示。－開真空泵15分鐘；－把TPR裝在真空泵抽氣管上；－開真空泵，約抽3分鐘真空，然后緩慢進氣；－約等10分鐘，TPR250應準確指示出大氣壓力，操作“C/mbar”換算鍵，用TPR250的“ATM”電位器檢正“AFF”“A－or”的過渡點。“HV”校正：用完好的級間葉輪回轉真空泵校正“高真空”數值。－把TPR250裝在真空泵上約抽10分鐘真空；－用TPR250的“HV”電位器校正0.0026至0.0030毫巴之間的數值。緩慢通氣然后再校正一遍。如檢驗中出現問題，應將傳感器送回工廠檢驗。真空度傳感器壽命有限，損壞時應進行更換。
6.冷阱或擱板溫度達不到
冷凍干燥機致冷系統有過壓保護，馬達設有過溫保護，環境溫度過高或過載時保護裝置動作，致冷系統停機。當工作條件恢復(幾分鐘后)，保護開關自動使機器重新運轉。如果冷阱器無負載并且冷阱室抽真空，冷阱應達到zui低溫度約－54℃。檢查是否有足夠通風條件。
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