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賽默飛為蛋白質組學用戶量身打造的全新一站式工作流

閱讀:684      發布時間:2022-8-11
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作為后基因組時代的重要組成部分,蛋白質組學經過二十幾年的發展,已經逐漸走向成熟。蛋白質組學流程復雜,有較高的操作和實驗技能的要求。其完整的實驗步驟一般包括實驗設計、樣品前處理(蛋白提取、定量、酶解、脫鹽等)、LC-MS/MS分析、數據庫檢索、生物信息學分析等多重步驟,而針對蛋白質組學步驟中繁瑣耗時或者實驗的穩定性、通量等用戶的關注熱點,賽默飛推出全新的為所有的蛋白質組學用戶量身打造的一站式工作流,以滿足用戶對高通量定性定量蛋白質組學的全部需求。

△圖1:滿足高通量定性定量蛋白質組學需求的

一站式工作流(點擊查看大圖)

賽默飛AccelerOme

自動化樣品前處理平臺

在蛋白質組學中,最為困擾大家的當屬樣品樣品的前處理制備過程,樣品制備過程繁瑣、耗時,欠缺標準化的處理步驟使得蛋白質組學在不同的操作人員、不同的實驗室之間重復性較差。針對這個痛點,賽默飛推出了全新的全自動的蛋白質組學樣品制備平臺AccelerOme(如圖2)。

△圖2:全自動的蛋白質組學樣品制備平臺

(點擊查看大圖)

AccelerOme可完成蛋白樣品的還原烷基化、酶解、TMT標記、脫鹽、多肽定量等多步操作(如圖3),其具有強大的魯棒性的硬件,搭配現成的預配置的試劑以及直觀的端到端軟件,使標準化的蛋白質組學制備流程走進萬千實驗室,解放雙手。

△圖3:AccelerOme自動化樣品前處理平臺在蛋白質組學全流程中的作用

(點擊查看大圖)

其中,AccelerOme的強大的適配軟件,支持使用者們從實驗設計到數據分析的全流程。在蛋白質組學以及生物制藥的HCP、藥代動力學實驗中,可幫助實驗人員更加簡便快速的獲得高質量的、可重復的樣品。

全新的μPAC™

Neo HPLC色譜柱

在LC-MS/MS檢測中,我們希望低流速的納升液相能夠提供更加穩健的表現和更高的日均檢測通量。為此,賽默飛于去年發布了全新的低流速液相Vanquish Neo,與之相匹配的,這次我們推出了全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色譜柱。

全新色譜柱優勢

★與普通的填充柱不同,全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色譜柱為微柱蝕刻技術,不同的色譜柱一致性強;

★同時低背壓設計,50cm色譜柱,300nl/min流速下,背壓僅110-150 bar;

★還可靈活適配于不同的工作流程,其可適配15-120min色譜梯度及5-500ng大范圍的上樣量。

全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色譜柱,在具有極其出色的性能的同時,兼具高度的魯棒性及更長的使用壽命(如圖4)。

△圖4:全新的50 cm μPAC™ Neo HPLC色譜柱多針上樣結果(從2月開始使用,間隔進行QC測試,共進行近500針QC測試)

(點擊查看大圖)

Proteome Discoverer™

3.0軟件搭配

CHIMERYS™搜索引擎

好馬配好鞍,除了前述的全新的自動化樣品前處理平臺、全新的色譜柱以及性能及其出色的Vanquish Neo低流速色譜儀和Orbitrap系列質譜儀器,本次全新一站式蛋白質組學工作流,還將推出升級版軟件Proteome Discoverer™ 3.0以及全新的智能搜索引擎CHIMERYS™。全新的CHIMERYS搜索算法是賽默飛與蛋白質組學人工智能領域的領dao者MSAID™合作的全新一代為解析混合譜而設計的人工智能算法,這種革命性的算法可以大大提升DDA數據中被識別的PSMs數,從而實現在鑒定數目上的性能斷層的巨大飛躍。

△圖5:CHIMERYS搜索引擎可以在復雜的混合譜中識別出更多的PSMs(點擊查看大圖)

△圖6:與前代軟件相比,CHIMERYS搜索引擎在鑒定量上帶來性能斷層的飛躍(點擊查看大圖)

CHIMERYS搜索引擎目前可支持的工作流程包括肽段與蛋白的鑒定、非標記定量(LFQ)、TMT(包括TMT Pro)標記的定性與定量需求,未來也將支持翻譯后修飾等需求。

賽默飛全新一站式工作流,為蛋白質組學用戶量身打造,可滿足用戶對高通量定性定量蛋白質組學的全部需求。賽默飛與各位科學工作者們一起,在蛋白質組學的領域里,揚帆起航,乘風破浪!

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