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OncoCyte選擇Ion Torrent助力肺癌檢測(cè)方案走向臨床

閱讀:37      發(fā)布時(shí)間:2024-11-20
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自O(shè)ncoCyte公司選擇賽默飛Ion GeneStudio S5二代測(cè)序平臺(tái)開(kāi)發(fā)癌癥早篩產(chǎn)品以來(lái),近日OncoCyte公司表示可在今年年底推出非侵入性(液體活檢)肺癌檢測(cè)方案,并使用人口對(duì)照,盲測(cè)樣本隊(duì)列執(zhí)行的內(nèi)部驗(yàn)證,從而獲得強(qiáng)大的性能數(shù)據(jù)。

DetermaVu™液體活檢肺癌檢測(cè)方案

OncoCyte公司的這一肺癌檢測(cè)方案稱為DetermaVu™,通過(guò)對(duì)一組與人體癌癥免疫應(yīng)答相關(guān)的基因表達(dá)生物標(biāo)志物進(jìn)行分析,確定偶然或篩檢發(fā)現(xiàn)的肺部結(jié)節(jié)是否會(huì)發(fā)展成癌癥

OncoCyte公司執(zhí)行官Bill Annett表示,這項(xiàng)檢測(cè)方案的應(yīng)用價(jià)值在于將大大減少不必要的肺組織活檢,因?yàn)榉尾炕顧z除價(jià)格高昂外,還存在較高的并發(fā)癥發(fā)生率。例如,近期在JAMA Internal Medicine上發(fā)表的一項(xiàng)研究調(diào)研了接受肺活檢的近350,000名患者的醫(yī)療記錄,并得出結(jié)論:65歲以下患者的并發(fā)癥發(fā)生率為22.2%,65歲及以上患者的并發(fā)癥發(fā)生率為24%。

OncoCyte選擇Ion Torrent二代測(cè)序平臺(tái)

OncoCyte公司在獲得Wistar研究所后開(kāi)始將DetermaVu™商業(yè)化,最初預(yù)計(jì)于2017年底在市場(chǎng)上推出該產(chǎn)品。然而,2017年底,原先使用的基因檢測(cè)平臺(tái)在重現(xiàn)性方面面臨一些挑戰(zhàn),從而使Oncyte公司開(kāi)始尋找更合適的工具來(lái)幫助DetermaVu™走向臨床。2018年,OncoCyte公司對(duì)四個(gè)平臺(tái)進(jìn)行了評(píng)估,最終選擇了Ion Torrent二代測(cè)序平臺(tái)

OncoCyte公司的研發(fā)高級(jí)副總裁Lyndal Hesterberg表示:

可以說(shuō)Ion Torrent二代測(cè)序平臺(tái)符合我們所有的期望,而且它確實(shí)能實(shí)現(xiàn)我們所需的性能。

OncoCyte在Ion Torrent平臺(tái)上分析700個(gè)樣本

雖然,OncoCyte公司對(duì)平臺(tái)和基因特征的重新考慮導(dǎo)致了公司商業(yè)計(jì)劃的推遲,Hesterberg仍認(rèn)為這一過(guò)程是必要的,這反映了OncoCyte公司對(duì)DetermaVu™的重視,要確保將其順利推向市場(chǎng)。

有趣的是,平臺(tái)評(píng)估過(guò)程導(dǎo)致的計(jì)劃延遲也為根據(jù)新基因表達(dá)陣列產(chǎn)品和數(shù)據(jù)重新檢測(cè)生物標(biāo)志物的特征提供了機(jī)會(huì),這些產(chǎn)品和數(shù)據(jù)集在DetermaVu™開(kāi)發(fā)初期還沒(méi)有,因此,OncoCyte公司決定增加新的生物標(biāo)志物,將其整合到新算法中。OncoCyte公司在本周報(bào)告驗(yàn)證數(shù)據(jù)之前,在Ion Torrent平臺(tái)上對(duì)700個(gè)樣本進(jìn)行了分析,增加的生物標(biāo)志物完善了其算法。

雖然平臺(tái)和生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)從頭開(kāi)始看起來(lái)是奇怪的舉措,但Hesterberg 稱,公司在驗(yàn)證中觀察到的性能優(yōu)勢(shì)是顯而易見(jiàn)的。

公司使用250個(gè)獨(dú)立盲測(cè)樣本檢測(cè)了DetermaVu™的性能,Hesterberg表示,這些樣本是專門(mén)為盡可能接近地反映接受檢測(cè)的實(shí)際臨床人群收集的。結(jié)果表明,該DetermaVu™assay的靈敏度為90%,特異性為75%,與公司2017年所預(yù)期的數(shù)據(jù)接近,并且有更強(qiáng)大的性能。

 

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